133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3534 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3534  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  597  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  28.24 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  29.54 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  31.22 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  31.4 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  30.71 
 
 		 298 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  28.95 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  27.78 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  28.63 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  29.91 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  30.9 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  30.47 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  28.04 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  30.47 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  26.48 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1817  hypothetical protein  28.8 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.294075  normal  0.846199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  30.9 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  30.71 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  28.33 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  28.84 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  28.41 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  26.84 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  29.02 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  27.6 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  29.96 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  29.72 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  25.09 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  29.24 
 
 		 314 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  29.03 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  31.25 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  28.45 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  29.66 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  26.34 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  25.49 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  27.14 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  25.93 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  25.83 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  24.79 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  25.1 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  25.95 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  26.29 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  28.08 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2382  hypothetical protein  28.9 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000769788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  30.63 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  28.96 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  25.79 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  28.03 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  28.65 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  25.2 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  25.83 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  25.31 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  27.2 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  26.69 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1275  hypothetical protein  26.14 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0364003  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  26.79 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  30 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  27.41 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  28.57 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  25.46 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  29.63 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  26.04 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  27.48 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  26.32 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  25.11 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  26.32 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  26.32 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  26.67 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  26.32 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  26.32 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  26.22 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  26.32 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  26.32 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  29.33 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  26.32 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  30.04 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  25.96 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  27.95 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  27.57 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  27.9 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  22.54 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  22.8 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  26.61 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  26.61 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  26.61 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  26.61 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  26.61 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  26.61 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  26.61 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  26.61 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  26.92 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  28.65 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  27.8 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  25.97 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  28 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  24.89 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  28 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  28 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  25.96 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0696  hypothetical protein  22.01 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02251  UPF0187 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06660)  23.51 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.493837  normal  0.193454 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>