48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3606 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  100 
 
 		 225 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  96 
 
 		 225 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  55.11 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  60.11 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  57.3 
 
 		 222 aa  215  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  49 
 
 		 218 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  49 
 
 		 218 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  48.91 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.81 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  26.11 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  29.21 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  29.3 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  28.14 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.29 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  31.95 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.87 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  22.64 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.5 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  25.71 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  25.3 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  25.27 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  23.81 
 
 		 271 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  23.81 
 
 		 271 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  27.27 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  23.91 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  22.52 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  25.14 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.84 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  24.58 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.15 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  22.78 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  22.12 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  24.19 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  21.69 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.43 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  20.26 
 
 		 172 aa  53.9  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  23.03 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0912  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.22 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  21.15 
 
 		 173 aa  49.3  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  25.62 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  26.67 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1206  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.15 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000867117  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  26.52 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  27.56 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  24.71 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.58 
 
 		 210 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>