141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3272 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  95.49 
 
 
610 aa  1028    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  94.76 
 
 
610 aa  1029    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
534 aa  1075    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  94.76 
 
 
610 aa  1029    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  94.76 
 
 
610 aa  1029    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  98.13 
 
 
611 aa  1067    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1538  serine protease  57.32 
 
 
633 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00041451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  57.85 
 
 
633 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  56.08 
 
 
694 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2037  serine protease  57.32 
 
 
633 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00522948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2473  serine protease  57.85 
 
 
628 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3274  serine protease  57.5 
 
 
633 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000323392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  57.67 
 
 
633 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1309  serine protease  57.5 
 
 
633 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000244171  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  54 
 
 
577 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.63 
 
 
577 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.63 
 
 
577 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  53.63 
 
 
577 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  53.06 
 
 
579 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.79 
 
 
579 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  52.5 
 
 
579 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  51.21 
 
 
582 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  51.21 
 
 
562 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  51.21 
 
 
562 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  50.84 
 
 
562 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1564  sedolisin-B  47.6 
 
 
644 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0399  serine protease  46.89 
 
 
669 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1080  sedolisin-B  46.26 
 
 
766 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.863455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1532  serine protease  46.26 
 
 
766 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2829  pseudomonalisin  46.44 
 
 
766 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2682  serine protease, subtilase family protein  46.26 
 
 
766 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0111  serine protease, subtilase family protein  46.26 
 
 
798 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0093  serine protease  46.62 
 
 
644 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1253  serine protease, subtilase family protein  46.09 
 
 
766 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  42.4 
 
 
788 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  42.38 
 
 
777 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  30.93 
 
 
534 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  33.52 
 
 
545 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  30.81 
 
 
524 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  30.74 
 
 
529 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  27.43 
 
 
672 aa  153  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  30.56 
 
 
577 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  30.56 
 
 
529 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  28.55 
 
 
1207 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.37 
 
 
1251 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  30.38 
 
 
529 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  30.38 
 
 
529 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0098  protease-like  28.62 
 
 
1223 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  30.02 
 
 
622 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  28.28 
 
 
626 aa  140  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0435  serine protease  52.98 
 
 
152 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  28.78 
 
 
529 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  28.6 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  29.3 
 
 
529 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  27.97 
 
 
540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3445  Peptidase S53 propeptide  27.98 
 
 
626 aa  134  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.49 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.49 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  28.14 
 
 
540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.41 
 
 
1271 aa  127  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.65 
 
 
529 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.16 
 
 
538 aa  124  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  28.36 
 
 
519 aa  124  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  29.9 
 
 
507 aa  123  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  29.07 
 
 
519 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  26.65 
 
 
533 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  27.9 
 
 
658 aa  120  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6409  Peptidase S53 propeptide  27.98 
 
 
1027 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.276013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  28.84 
 
 
553 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  26.22 
 
 
539 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0459  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.52 
 
 
1193 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245222  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0105  protease-like  26.84 
 
 
1478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.34808 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  26.95 
 
 
1308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  26.46 
 
 
976 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  27.26 
 
 
1073 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8631  Peptidase S53 propeptide  27.57 
 
 
648 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00652442  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  29.61 
 
 
553 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8673  Peptidase S53 propeptide  26.75 
 
 
657 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032091  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  27.35 
 
 
523 aa  103  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  29.47 
 
 
531 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  38.79 
 
 
788 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  38.36 
 
 
710 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2356  serine protease  50 
 
 
190 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03680  proteinase  30.1 
 
 
307 aa  90.5  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  27.77 
 
 
998 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  31.84 
 
 
592 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  30.03 
 
 
413 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  24.02 
 
 
1270 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0859  serine protease  25.42 
 
 
527 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444174  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1759  kumamolisin  25.93 
 
 
551 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  26.09 
 
 
534 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  30.46 
 
 
682 aa  84  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8798  Peptidase S53 propeptide  25.77 
 
 
610 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424248  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04349  protease  36.56 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.64 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  30.21 
 
 
672 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.55 
 
 
403 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  25.04 
 
 
1378 aa  77  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3631  serine protease  30.19 
 
 
381 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523915  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.91 
 
 
464 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>