More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2740 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 328 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  92.99 
 
 		 353 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  91.46 
 
 		 328 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  91.46 
 
 		 328 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  91.46 
 
 		 328 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  90.24 
 
 		 328 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  74.31 
 
 		 342 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  72.78 
 
 		 339 aa  494  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  73.7 
 
 		 338 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  72.48 
 
 		 339 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  71.87 
 
 		 339 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  71.87 
 
 		 339 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  71.87 
 
 		 339 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  71.87 
 
 		 339 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  71.87 
 
 		 339 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  71.87 
 
 		 339 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  71.87 
 
 		 339 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  61.03 
 
 		 331 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  47.56 
 
 		 328 aa  318  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  47.56 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.39 
 
 		 329 aa  316  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  48.48 
 
 		 328 aa  315  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  52.91 
 
 		 334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  48.48 
 
 		 328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  50.15 
 
 		 327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  47.87 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  48.48 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  47.56 
 
 		 336 aa  305  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  47.53 
 
 		 329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  49.24 
 
 		 330 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  48.93 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.85 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  48.62 
 
 		 330 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  46.63 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  46.22 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.48 
 
 		 335 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  48.32 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  48.62 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  46.95 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  41.27 
 
 		 336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  46.39 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  45.69 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.38 
 
 		 341 aa  262  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.69 
 
 		 341 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  40.38 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  40.38 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  42.56 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  41.87 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  39.75 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  40.67 
 
 		 334 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  39.57 
 
 		 342 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  44.11 
 
 		 336 aa  242  7e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  42.6 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  41.95 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  41.59 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  36.17 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  42.17 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  41.23 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  39.26 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  41.26 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  36.2 
 
 		 347 aa  219  3.9999999999999997e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  38.46 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  43.37 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  39.1 
 
 		 335 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  38.73 
 
 		 342 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  37.39 
 
 		 342 aa  212  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  36.11 
 
 		 338 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  37.04 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  41.16 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  35.89 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  37.46 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  36.56 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  36.59 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  36.53 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  37.3 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  34.65 
 
 		 344 aa  175  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  34.42 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  36.01 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.34 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.86 
 
 		 350 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  36.59 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  36.08 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  39.25 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  33.83 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.99 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  34.63 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  33.53 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  34.93 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  35.56 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  34.33 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  38.34 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  35.67 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  35.29 
 
 		 345 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  35.29 
 
 		 345 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  35.29 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  35.29 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.86 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  38.64 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>