84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5030 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  100 
 
 		 312 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  94.87 
 
 		 312 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  89.74 
 
 		 312 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  89.42 
 
 		 312 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  88.85 
 
 		 312 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  88.85 
 
 		 312 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  65.5 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  65.18 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  64.86 
 
 		 331 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  65.18 
 
 		 331 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  64.86 
 
 		 331 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  65.18 
 
 		 331 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  64.86 
 
 		 331 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  64.86 
 
 		 331 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  65.18 
 
 		 331 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  64.67 
 
 		 335 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  64.67 
 
 		 335 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  65.18 
 
 		 331 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  65.18 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  65.18 
 
 		 331 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  65.35 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  65.35 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  50.65 
 
 		 325 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  38.16 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  38.7 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  38.97 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  38.62 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  38.62 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  32.79 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.54 
 
 		 287 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  30.41 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  28.9 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  31.76 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  33.09 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  33.09 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  28.76 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.5 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  27.3 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  28.15 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  27.18 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  26.23 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  28.66 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  24.83 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  26 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  29.93 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  30.35 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  30.13 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  28.9 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  22.46 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  24.03 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  21.34 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  27.96 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 		 282 aa  54.3  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  27.96 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  22.19 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  18.78 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  21.89 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  26.73 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3026  putative glycosyltransferase  22.28 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  23.41 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 		 970 aa  42.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 346 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>