94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4849 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
134 aa  277  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  77.31 
 
 
376 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  77.31 
 
 
376 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  76.47 
 
 
359 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  73.11 
 
 
376 aa  188  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  71.43 
 
 
391 aa  186  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  71.43 
 
 
391 aa  185  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  71.43 
 
 
391 aa  185  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  71.43 
 
 
391 aa  185  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  71.43 
 
 
391 aa  185  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  71.43 
 
 
391 aa  185  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  71.43 
 
 
391 aa  185  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  71.43 
 
 
391 aa  185  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  70.59 
 
 
391 aa  184  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  70.59 
 
 
391 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  70.59 
 
 
391 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  70.59 
 
 
391 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.99 
 
 
370 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.99 
 
 
370 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.99 
 
 
370 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  54.46 
 
 
159 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  50.43 
 
 
332 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 
369 aa  114  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  50 
 
 
229 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  50 
 
 
384 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.22 
 
 
372 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.79 
 
 
369 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.79 
 
 
369 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.79 
 
 
369 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.12 
 
 
369 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  50 
 
 
265 aa  110  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.9 
 
 
369 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.9 
 
 
369 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  46.22 
 
 
371 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  48.21 
 
 
403 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.31 
 
 
373 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  47.5 
 
 
384 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.22 
 
 
366 aa  100  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  44.44 
 
 
243 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.64 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  39.64 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  84.62 
 
 
296 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.23 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4141  putative transposase  41.67 
 
 
72 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.67819  normal  0.487019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  38.1 
 
 
358 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2554  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
321 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.964231  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  44.83 
 
 
382 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  34.51 
 
 
261 aa  47.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  33.88 
 
 
368 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  33.88 
 
 
368 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.61 
 
 
374 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3243  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.73 
 
 
321 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.73 
 
 
321 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.73 
 
 
321 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1820  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.73 
 
 
321 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161882  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1633  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.73 
 
 
321 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0380198  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1462  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.73 
 
 
321 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1511  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.18 
 
 
320 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0532296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2941  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.18 
 
 
320 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2558  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.18 
 
 
320 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.18 
 
 
320 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.83 
 
 
347 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0925  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.18 
 
 
320 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 
347 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2773  transposase IS116/IS110/IS902  31.25 
 
 
385 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  36.67 
 
 
379 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3633  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.18 
 
 
320 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1954  transposase IS116/IS110/IS902  31.25 
 
 
385 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 
347 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4589  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0433  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3125  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618983  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  27.56 
 
 
379 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1737  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3874  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3803  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3703  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3255  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  hitchhiker  0.00658118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2915  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0072  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413963  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0777  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341483  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  27.56 
 
 
379 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0821  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2281  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2843  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0584  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3882  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0788  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4514  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.654029  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1326  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0664972  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1531  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1627  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2288  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4517  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
320 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000931512  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>