More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4290 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  94.49 
 
 		 346 aa  664    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 346 aa  700    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  98.55 
 
 		 346 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  81.5 
 
 		 346 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  82.37 
 
 		 346 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  81.79 
 
 		 346 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  80.92 
 
 		 349 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  79.48 
 
 		 346 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  79.48 
 
 		 346 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  79.48 
 
 		 346 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  79.48 
 
 		 346 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  79.48 
 
 		 346 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  79.48 
 
 		 346 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  77.84 
 
 		 345 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  78.2 
 
 		 355 aa  557  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  78.2 
 
 		 345 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  74.2 
 
 		 347 aa  545  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  74.71 
 
 		 345 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  74.42 
 
 		 345 aa  534  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  72.59 
 
 		 344 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  72.89 
 
 		 370 aa  522  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  70.52 
 
 		 346 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  68.8 
 
 		 346 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  67.35 
 
 		 346 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  68.79 
 
 		 347 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  61.22 
 
 		 343 aa  448  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.52 
 
 		 342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  60.76 
 
 		 347 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.23 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  59.6 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  59.77 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.03 
 
 		 351 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.98 
 
 		 351 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  56.98 
 
 		 351 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  56.77 
 
 		 348 aa  394  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  56.98 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.78 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  55.91 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2112  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  55.07 
 
 		 350 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0323338  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.59 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  53.94 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  59.73 
 
 		 299 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.87 
 
 		 350 aa  342  5e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  46.43 
 
 		 352 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4893  alcohol dehydrogenase  44.04 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.06 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  40.23 
 
 		 374 aa  236  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.36 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.13 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.36 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.33 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.17 
 
 		 357 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.23 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  38.2 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.61 
 
 		 384 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.67 
 
 		 384 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.34 
 
 		 384 aa  222  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  38.78 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 		 366 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  38.66 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.25 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.4 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  37.8 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.64 
 
 		 366 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 		 396 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 		 401 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  36.08 
 
 		 364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.1 
 
 		 410 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1507  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.64 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 		 387 aa  212  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 		 384 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 		 388 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  37.71 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 		 410 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.71 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.99 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.44 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 		 422 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 		 415 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.48 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2438  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.98 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.931486  hitchhiker  0.00356491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  43.73 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.72 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0696766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.9 
 
 		 385 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 		 402 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.21 
 
 		 411 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 400 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.33 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>