140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3792 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  94.27 
 
 		 610 aa  1098    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  92.64 
 
 		 610 aa  1093    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  98.13 
 
 		 534 aa  1067    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  92.64 
 
 		 610 aa  1093    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  92.64 
 
 		 610 aa  1093    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  100 
 
 		 611 aa  1232    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  52.87 
 
 		 694 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1538  serine protease  57.62 
 
 		 633 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00041451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  58.14 
 
 		 633 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2037  serine protease  57.62 
 
 		 633 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00522948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2473  serine protease  58.14 
 
 		 628 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3274  serine protease  57.79 
 
 		 633 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000323392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  57.97 
 
 		 633 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1309  serine protease  57.79 
 
 		 633 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000244171  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  52 
 
 		 577 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.65 
 
 		 577 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.65 
 
 		 577 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  51.55 
 
 		 579 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  51.65 
 
 		 577 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.22 
 
 		 579 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  50.95 
 
 		 579 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  48.37 
 
 		 582 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  50.52 
 
 		 562 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  50.52 
 
 		 562 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  49.4 
 
 		 562 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0399  serine protease  44.85 
 
 		 669 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1564  sedolisin-B  44.99 
 
 		 644 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1080  sedolisin-B  43.56 
 
 		 766 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.863455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1532  serine protease  43.56 
 
 		 766 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2829  pseudomonalisin  43.71 
 
 		 766 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2682  serine protease, subtilase family protein  43.56 
 
 		 766 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0111  serine protease, subtilase family protein  43.56 
 
 		 798 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0093  serine protease  43.87 
 
 		 644 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1253  serine protease, subtilase family protein  43.4 
 
 		 766 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  42.25 
 
 		 788 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  42.8 
 
 		 777 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  30 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  32.63 
 
 		 545 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  30.31 
 
 		 524 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  28.07 
 
 		 672 aa  154  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  30.07 
 
 		 529 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  30.38 
 
 		 577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  29.89 
 
 		 529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  29.71 
 
 		 529 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  29.71 
 
 		 529 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.82 
 
 		 1251 aa  148  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0098  protease-like  28.31 
 
 		 1223 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  27.83 
 
 		 1207 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0435  serine protease  53.64 
 
 		 152 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  28.8 
 
 		 519 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  29.84 
 
 		 622 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  28.5 
 
 		 626 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  28.88 
 
 		 529 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  28.29 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3445  Peptidase S53 propeptide  27.73 
 
 		 626 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.06 
 
 		 529 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.06 
 
 		 529 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  27.83 
 
 		 540 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  28.33 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.7 
 
 		 538 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.34 
 
 		 529 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.41 
 
 		 1271 aa  126  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  28.01 
 
 		 519 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  28.36 
 
 		 519 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  30.24 
 
 		 507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  27.05 
 
 		 533 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  29.87 
 
 		 553 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6409  Peptidase S53 propeptide  28.03 
 
 		 1027 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.276013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  27.31 
 
 		 658 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0105  protease-like  26.68 
 
 		 1478 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  26.03 
 
 		 539 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0459  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.26 
 
 		 1193 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245222  normal  0.621321 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  28.33 
 
 		 1308 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8673  Peptidase S53 propeptide  27.77 
 
 		 657 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  27.07 
 
 		 1073 aa  108  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  25.51 
 
 		 976 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  29.61 
 
 		 553 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8631  Peptidase S53 propeptide  27.08 
 
 		 648 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00652442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  27.56 
 
 		 523 aa  103  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2356  serine protease  35.68 
 
 		 190 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  38.36 
 
 		 788 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  37.93 
 
 		 710 aa  97.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  29.05 
 
 		 531 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03680  proteinase  30.45 
 
 		 307 aa  91.3  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  31.58 
 
 		 592 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  27.04 
 
 		 998 aa  84.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04349  protease  37.1 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  29.77 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  30.19 
 
 		 682 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  26.85 
 
 		 534 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0859  serine protease  27.68 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444174  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  24.02 
 
 		 1270 aa  82  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  30.48 
 
 		 672 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1759  kumamolisin  25.62 
 
 		 551 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8798  Peptidase S53 propeptide  25.77 
 
 		 610 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424248  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0081  Peptidase S53 propeptide  24.5 
 
 		 696 aa  78.2  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.77 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0196  Peptidase S53 propeptide  24.67 
 
 		 695 aa  77  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.52 
 
 		 464 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.68 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>