78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0728 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  99.09 
 
 
331 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  98.79 
 
 
331 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  97.61 
 
 
335 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  98.79 
 
 
331 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  97.61 
 
 
335 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  100 
 
 
331 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  100 
 
 
331 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  98.79 
 
 
331 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  99.09 
 
 
331 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  99.4 
 
 
331 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  98.79 
 
 
331 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  99.09 
 
 
331 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  99.09 
 
 
331 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  99.09 
 
 
331 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  92.56 
 
 
321 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  92.56 
 
 
321 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  63.8 
 
 
312 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  65.16 
 
 
312 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  64.86 
 
 
312 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  64.84 
 
 
312 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  64.84 
 
 
312 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  64.52 
 
 
312 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  45.51 
 
 
325 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  40.51 
 
 
309 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  40.71 
 
 
294 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  40.13 
 
 
294 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  40.13 
 
 
294 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  40.13 
 
 
294 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  29.75 
 
 
298 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.58 
 
 
287 aa  99  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  32.14 
 
 
303 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  29.67 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
301 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  29.39 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
295 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  28.75 
 
 
286 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  28.75 
 
 
286 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  25.16 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  28.71 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  28.34 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  28.34 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  31.25 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.26 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  30.31 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  29.27 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  24.6 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
321 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  42.11 
 
 
301 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  20 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  42.11 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2534  hypothetical protein  23.12 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  28.44 
 
 
302 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  29.51 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  22.05 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 
319 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  20.32 
 
 
282 aa  49.7  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  23.94 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  39.44 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1650  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
679 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  26.89 
 
 
301 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  21.92 
 
 
722 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
306 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
489 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  17.99 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
333 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 
307 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>