48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3697 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  100 
 
 		 512 aa  1039    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3667  hypothetical protein  44.67 
 
 		 518 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2969  hypothetical protein  38.57 
 
 		 412 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4351  hypothetical protein  39.33 
 
 		 395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1283  AAA ATPase  40.83 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261303  normal  0.841625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  37.08 
 
 		 797 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2513  hypothetical protein  24.89 
 
 		 536 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  25.96 
 
 		 464 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  25.96 
 
 		 464 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  25.48 
 
 		 464 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0543  hypothetical protein  25.25 
 
 		 286 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  25 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  24.39 
 
 		 462 aa  49.3  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  25.96 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0023  cpp26  25.65 
 
 		 597 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.85156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  24.39 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  24.66 
 
 		 352 aa  47.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  30.93 
 
 		 610 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  24.19 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  27.13 
 
 		 796 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  24.19 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0195  putative replicative DNA helicase protein  26.45 
 
 		 289 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.449191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1198  putative replicative DNA helicase protein  26.45 
 
 		 299 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  25.99 
 
 		 292 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2402  DNA repair protein RadA  24.88 
 
 		 489 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  23.56 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  27.74 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  25.24 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  25.19 
 
 		 841 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  26.45 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  28.4 
 
 		 665 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  26.29 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  23.94 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  26.58 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  24.41 
 
 		 465 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  24.41 
 
 		 465 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  26.25 
 
 		 457 aa  44.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  24.41 
 
 		 465 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  23.43 
 
 		 610 aa  44.3  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  24.04 
 
 		 464 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  26.06 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  25.49 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  24.52 
 
 		 719 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  23.43 
 
 		 610 aa  44.3  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  23.67 
 
 		 458 aa  44.3  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  26.59 
 
 		 292 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  25.45 
 
 		 454 aa  43.9  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1388  hypothetical protein  26.48 
 
 		 206 aa  43.5  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>