87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0684 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0676  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  99.69 
 
 		 318 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0684  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  100 
 
 		 318 aa  657    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2604  SurA domain-containing protein  85.27 
 
 		 319 aa  568  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.960846  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0505  SurA domain-containing protein  47.77 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1760  putative survival protein surA precursor (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA)  46.46 
 
 		 312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172178  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1539  hypothetical protein  46.23 
 
 		 315 aa  258  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0762  SurA domain-containing protein  47.04 
 
 		 315 aa  255  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1065  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  44.78 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00053562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1208  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  45.61 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  hitchhiker  0.000180052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2969  hypothetical protein  29.84 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2310  hypothetical protein  28.31 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2477  hypothetical protein  29.56 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1680  hypothetical protein  29.05 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.282986  normal  0.933531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2835  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.53 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  0.151219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2343  hypothetical protein  28.92 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3828  hypothetical protein  27.07 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.068458  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2224  hypothetical protein  28.72 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0653  hypothetical protein  29.54 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3474  SurA domain  30.84 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.57 
 
 		 446 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0946  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.34 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323241  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0899  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.98 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1187  SurA domain protein  27.81 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614007  normal  0.705805 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  24.55 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0888  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.19 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0501043  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1118  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.43 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.92 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.09 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.07 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.54 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.16 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2903  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.35 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1547  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.35 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1811  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  27.67 
 
 		 422 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.27 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.44 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  21.7 
 
 		 465 aa  53.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.57 
 
 		 482 aa  52.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  21.14 
 
 		 434 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4524  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.65 
 
 		 433 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.16 
 
 		 498 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1223  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.35 
 
 		 435 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0143633  normal  0.258985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3442  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.27 
 
 		 434 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000041378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0770  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.27 
 
 		 434 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524485  normal  0.0902851 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2077  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  19.2 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3571  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.27 
 
 		 434 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.5 
 
 		 434 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0991  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.47 
 
 		 434 aa  50.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000134867  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0907  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.5 
 
 		 434 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00235031  normal  0.382454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.5 
 
 		 434 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.980889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3043  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 		 452 aa  50.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2527  SurA domain-containing protein  26.5 
 
 		 452 aa  49.7  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1266  hypothetical protein  24.54 
 
 		 399 aa  49.3  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.279475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1081  SurA domain-containing protein  19.87 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00545123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  22.15 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0203  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.08 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.701939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3311  SurA domain protein  19.87 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000542375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1048  SurA domain-containing protein  19.87 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000188646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3077  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.21 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.83 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  22.7 
 
 		 475 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  21.38 
 
 		 439 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.24 
 
 		 447 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  21.38 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2817  survival protein surA  22.29 
 
 		 434 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.705055  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1573  SurA domain  27.87 
 
 		 482 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.27 
 
 		 433 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.84 
 
 		 493 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0097  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.05 
 
 		 459 aa  46.2  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  21.2 
 
 		 441 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0407  SurA domain protein  23.27 
 
 		 500 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0392  SurA domain  23.27 
 
 		 500 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.74 
 
 		 476 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0604  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.73 
 
 		 433 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.54 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0698  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.48 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000883424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  25.14 
 
 		 475 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3912  SurA domain-containing protein  22.22 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0794  hypothetical protein  21.08 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.1 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4874  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.22 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.165645  normal  0.245962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  22.22 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.85 
 
 		 427 aa  43.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0146  hypothetical protein  27.27 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0022721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3549  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.39 
 
 		 333 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000983589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.05 
 
 		 440 aa  42.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0498  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.22 
 
 		 499 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.307717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>