36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0146 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0146  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0022721  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0243  putative periplasmic protein  30 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2197  hypothetical protein  28.42 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000001715  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1563  putative periplasmic protein  28.62 
 
 
275 aa  124  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0019619  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0549  ferric receptor CfrA  28.84 
 
 
291 aa  124  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.234857  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1294  hypothetical protein  27.74 
 
 
275 aa  122  7e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1481  hypothetical protein  29.24 
 
 
271 aa  118  9e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1306  hypothetical protein  29.6 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0433  hypothetical protein  29.24 
 
 
271 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0110  putative periplasmic protein  29.23 
 
 
275 aa  101  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  25.43 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.45 
 
 
343 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0015  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  25.48 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  22.03 
 
 
311 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  27.78 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.1 
 
 
345 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0912  SurA domain protein  22.92 
 
 
311 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.557148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3549  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.24 
 
 
333 aa  52.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000983589  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.7 
 
 
316 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3589  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.45 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000412854  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0014  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.1 
 
 
418 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.35 
 
 
435 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0199  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.14 
 
 
317 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000517343 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4334  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.57 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0505  SurA domain-containing protein  30 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1601  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.36 
 
 
635 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  22.36 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.68 
 
 
359 aa  43.9  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000363046  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1078  hypothetical protein  23.65 
 
 
340 aa  43.5  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4489  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.57 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4470  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.57 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2037  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  23.39 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 
438 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0676  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.27 
 
 
318 aa  42.7  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0684  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  27.27 
 
 
318 aa  42.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0911  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.09 
 
 
354 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.159559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>