More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1539 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  100 
 
 
636 aa  1317    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  62.71 
 
 
604 aa  835    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  42.46 
 
 
581 aa  504  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  41 
 
 
588 aa  484  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  38.37 
 
 
581 aa  415  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  37.7 
 
 
578 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  35.49 
 
 
580 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  37.07 
 
 
589 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.94 
 
 
573 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.6 
 
 
606 aa  350  6e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.6 
 
 
601 aa  341  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.06 
 
 
587 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.44 
 
 
607 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  34.26 
 
 
581 aa  333  6e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.66 
 
 
575 aa  331  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  33.07 
 
 
582 aa  330  5.0000000000000004e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.39 
 
 
597 aa  329  8e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  37.43 
 
 
591 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.39 
 
 
597 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.07 
 
 
614 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.75 
 
 
577 aa  328  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  33.87 
 
 
608 aa  327  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.06 
 
 
598 aa  325  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  34.77 
 
 
541 aa  323  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  32.25 
 
 
594 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.61 
 
 
617 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  34.05 
 
 
569 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  35.48 
 
 
650 aa  320  7e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  32.95 
 
 
588 aa  319  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  32.6 
 
 
625 aa  319  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  35.71 
 
 
641 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  35.44 
 
 
589 aa  317  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  33.66 
 
 
578 aa  317  6e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  34.02 
 
 
644 aa  316  8e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  35.16 
 
 
640 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  32.52 
 
 
617 aa  315  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  32.85 
 
 
582 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.35 
 
 
636 aa  314  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  34.1 
 
 
594 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  33.64 
 
 
588 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  33.33 
 
 
575 aa  313  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.73 
 
 
567 aa  313  9e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  32.09 
 
 
604 aa  312  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  33.39 
 
 
567 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.82 
 
 
597 aa  310  4e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  32.04 
 
 
589 aa  310  4e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  31.97 
 
 
584 aa  310  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  33.11 
 
 
581 aa  310  5.9999999999999995e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  34.59 
 
 
592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  33.33 
 
 
580 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  35.4 
 
 
648 aa  307  4.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  36.04 
 
 
642 aa  306  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  35.47 
 
 
660 aa  306  7e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  35.45 
 
 
586 aa  306  9.000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.06 
 
 
578 aa  306  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.06 
 
 
578 aa  306  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  30.69 
 
 
651 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.28 
 
 
571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  32.95 
 
 
611 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  32.17 
 
 
583 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.01 
 
 
583 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  36.28 
 
 
572 aa  304  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  31.85 
 
 
583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  31.85 
 
 
583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.28 
 
 
571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.28 
 
 
571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  36.4 
 
 
600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.85 
 
 
583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.28 
 
 
571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  31.9 
 
 
635 aa  304  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  33.01 
 
 
580 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  31.85 
 
 
583 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  32.41 
 
 
577 aa  303  5.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  33.65 
 
 
585 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.12 
 
 
571 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.96 
 
 
571 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  32.01 
 
 
609 aa  303  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  33.78 
 
 
569 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  33.85 
 
 
579 aa  303  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  33.45 
 
 
589 aa  303  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  33.28 
 
 
597 aa  303  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  32.01 
 
 
583 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  31.48 
 
 
611 aa  302  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.96 
 
 
571 aa  302  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  34.03 
 
 
581 aa  302  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  36.4 
 
 
578 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.01 
 
 
583 aa  302  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.03 
 
 
567 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.36 
 
 
586 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.88 
 
 
586 aa  301  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.12 
 
 
571 aa  301  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.12 
 
 
571 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.12 
 
 
571 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.88 
 
 
586 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  32.39 
 
 
628 aa  301  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  34.14 
 
 
658 aa  300  4e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  34.41 
 
 
583 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  32.64 
 
 
671 aa  300  6e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.88 
 
 
586 aa  300  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.88 
 
 
586 aa  300  6e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>