26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1049 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  100 
 
 
302 aa  611  9.999999999999999e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0820  Co/Zn/Cd cation transporter  40.13 
 
 
301 aa  229  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00173784  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1884  Co/Zn/Cd cation transporter  34.33 
 
 
307 aa  209  6e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  31.54 
 
 
305 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0281  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0952355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2946  cation efflux protein  25.82 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  24.32 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  20.54 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  25.24 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  22.89 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  25.62 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  21.95 
 
 
320 aa  49.7  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  22.18 
 
 
329 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  22.89 
 
 
303 aa  49.3  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  21.17 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  21.89 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  25.47 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  22.27 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  27.81 
 
 
370 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  25.47 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  25.47 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  26.21 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  22.27 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  22.6 
 
 
312 aa  43.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  22.6 
 
 
312 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  21.56 
 
 
312 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>