More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0214 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  62.64 
 
 
554 aa  695    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0214  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 
569 aa  1162    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  58.52 
 
 
571 aa  663    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  59.96 
 
 
564 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  57.01 
 
 
568 aa  612  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  54.28 
 
 
565 aa  595  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  48.51 
 
 
607 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  50 
 
 
563 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  48.44 
 
 
586 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  48.84 
 
 
603 aa  534  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  46.45 
 
 
619 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  48.83 
 
 
576 aa  524  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.92 
 
 
616 aa  520  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.65 
 
 
575 aa  519  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  47.32 
 
 
566 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.91 
 
 
597 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  45.12 
 
 
611 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  45.81 
 
 
612 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  44.95 
 
 
611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
623 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  45.55 
 
 
568 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  45.44 
 
 
624 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  45.26 
 
 
623 aa  465  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  42.31 
 
 
606 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 
609 aa  459  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  45.26 
 
 
640 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  41.5 
 
 
629 aa  457  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  44.19 
 
 
615 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  44.17 
 
 
609 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  44.81 
 
 
619 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  44.52 
 
 
611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  42.36 
 
 
623 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 
623 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  42.83 
 
 
623 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  42.83 
 
 
623 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  42.71 
 
 
623 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  42.2 
 
 
617 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 
629 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.48 
 
 
612 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  43.88 
 
 
593 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 
623 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  42.08 
 
 
633 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  41.45 
 
 
623 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  44.74 
 
 
583 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.82 
 
 
568 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  42.48 
 
 
612 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.16 
 
 
599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.56 
 
 
611 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  42.66 
 
 
583 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 
632 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  42.23 
 
 
630 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  42.73 
 
 
619 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.34 
 
 
633 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  42.48 
 
 
609 aa  445  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  43.47 
 
 
562 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 
627 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.26 
 
 
649 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  45.27 
 
 
592 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  45.09 
 
 
592 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  44.34 
 
 
599 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.91 
 
 
619 aa  442  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  43.85 
 
 
573 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  44.91 
 
 
592 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.17 
 
 
629 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  42.63 
 
 
610 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.96 
 
 
631 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  43.65 
 
 
597 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.22 
 
 
615 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.25 
 
 
617 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  42.93 
 
 
593 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  42.55 
 
 
556 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  42.63 
 
 
601 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.92 
 
 
629 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  43.67 
 
 
545 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  42 
 
 
640 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  41.07 
 
 
623 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.04 
 
 
632 aa  435  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  41.82 
 
 
640 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.12 
 
 
555 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  40.03 
 
 
620 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.71 
 
 
633 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  42.25 
 
 
555 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  40.9 
 
 
623 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.92 
 
 
626 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.12 
 
 
634 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  42.29 
 
 
629 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 
633 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 
623 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  42.31 
 
 
578 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.56 
 
 
643 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 
623 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  40.9 
 
 
623 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  42.13 
 
 
586 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  41.36 
 
 
530 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  43.56 
 
 
613 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  41.36 
 
 
530 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  42.81 
 
 
544 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 
625 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.29 
 
 
634 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  42.33 
 
 
566 aa  430  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>