243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3144 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  48.77 
 
 		 1115 aa  968    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  46.88 
 
 		 1104 aa  934    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1714  cobaltochelatase subunit CobN  48.76 
 
 		 1143 aa  884    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185329  decreased coverage  0.00608846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2438  cobaltochelatase subunit CobN  51.08 
 
 		 1099 aa  860    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.621018  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2827  cobaltochelatase subunit CobN  44.22 
 
 		 1078 aa  794    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1518  cobaltochelatase subunit CobN  44.92 
 
 		 1078 aa  805    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0624953  normal  0.136834 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  35.17 
 
 		 1263 aa  646    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3115  cobaltochelatase subunit CobN  49.52 
 
 		 1109 aa  883    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0342  cobaltochelatase subunit CobN  46.29 
 
 		 1094 aa  806    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2931  cobaltochelatase subunit CobN  44.7 
 
 		 1090 aa  840    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347121  hitchhiker  0.00673529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1889  cobaltochelatase subunit CobN  46.59 
 
 		 1108 aa  858    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2149  cobaltochelatase subunit CobN  50.76 
 
 		 1103 aa  896    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304993  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  39.13 
 
 		 1263 aa  803    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2210  cobaltochelatase subunit CobN  43.88 
 
 		 1081 aa  776    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  31 
 
 		 1363 aa  643    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3144  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 		 1140 aa  2226    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1436  cobaltochelatase subunit CobN  48.94 
 
 		 1144 aa  893    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11738  normal  0.80922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2532  cobaltochelatase subunit CobN  44.42 
 
 		 1056 aa  785    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  41.75 
 
 		 1330 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3286  cobaltochelatase subunit CobN  49.69 
 
 		 1126 aa  874    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201105  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1468  cobaltochelatase subunit CobN  44.4 
 
 		 1078 aa  797    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1439  cobaltochelatase subunit CobN  48.93 
 
 		 1143 aa  901    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.293615  normal  0.816429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  34.15 
 
 		 1205 aa  571  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  34.62 
 
 		 1198 aa  559  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  34.62 
 
 		 1198 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  34.62 
 
 		 1198 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  33.94 
 
 		 1193 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  33.66 
 
 		 1213 aa  551  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  34.19 
 
 		 1199 aa  551  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  35.15 
 
 		 1190 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  34.53 
 
 		 1207 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  34.17 
 
 		 1209 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  33.89 
 
 		 1194 aa  531  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  45.01 
 
 		 1240 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  33.74 
 
 		 1206 aa  515  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  41.32 
 
 		 1260 aa  509  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  41.23 
 
 		 1273 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  41.79 
 
 		 1263 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  41.66 
 
 		 1263 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  41.75 
 
 		 1235 aa  488  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  33.22 
 
 		 1203 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.43 
 
 		 1152 aa  481  1e-134  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  39.49 
 
 		 1254 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  41.51 
 
 		 1248 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  40 
 
 		 1248 aa  475  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  39.69 
 
 		 1253 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  39.1 
 
 		 1257 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  41.65 
 
 		 1248 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  26.97 
 
 		 1220 aa  473  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  38.89 
 
 		 1253 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  39.03 
 
 		 1253 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  39.03 
 
 		 1253 aa  466  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  40.51 
 
 		 1286 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  41.4 
 
 		 1273 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  38.54 
 
 		 1254 aa  459  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  39.12 
 
 		 1269 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  40.79 
 
 		 1249 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  39.8 
 
 		 1269 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  38.9 
 
 		 1267 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  42.26 
 
 		 1247 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  39.49 
 
 		 1267 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  35.39 
 
 		 1288 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  39.77 
 
 		 1270 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  39.77 
 
 		 1269 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  39.91 
 
 		 1270 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  39.77 
 
 		 1269 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  39.86 
 
 		 1269 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  40.43 
 
 		 1269 aa  445  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  36.46 
 
 		 1247 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  36.46 
 
 		 1247 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  36.06 
 
 		 1261 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  39.52 
 
 		 1281 aa  433  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  39.52 
 
 		 1281 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  39.52 
 
 		 1281 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  37.43 
 
 		 1293 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  39.29 
 
 		 1278 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  33.6 
 
 		 1290 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  48.63 
 
 		 1388 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  30.58 
 
 		 1192 aa  410  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2900  cobaltochelatase, CobN subunit  36.91 
 
 		 1348 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  25.85 
 
 		 1229 aa  403  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  32.69 
 
 		 1253 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  30.5 
 
 		 1243 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  28 
 
 		 1323 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  27.55 
 
 		 1551 aa  361  5e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  36.49 
 
 		 1237 aa  360  7e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.02 
 
 		 1242 aa  360  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  30.42 
 
 		 1250 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  34.25 
 
 		 1259 aa  356  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  27.08 
 
 		 1318 aa  349  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  29.11 
 
 		 1187 aa  348  3e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  27.91 
 
 		 1187 aa  348  3e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  29.12 
 
 		 1250 aa  347  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  44.76 
 
 		 1220 aa  346  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  44.76 
 
 		 1220 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  44.76 
 
 		 1220 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  44.76 
 
 		 1220 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  37.63 
 
 		 1264 aa  342  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  29.41 
 
 		 1253 aa  341  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  34.13 
 
 		 1256 aa  339  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>