More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1124 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1124  class I peptide chain release factor domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3282  peptide chain release factor H  49.11 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434629  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3456  peptide chain release factor-like protein  34.76 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0652118  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0349  peptide chain release factor-like protein  41.83 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0354  peptide chain release factor-like protein  41.35 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0356  peptide chain release factor-like protein  41.35 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000967755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0345  peptide chain release factor-like protein  41.35 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0364  peptide chain release factor-like protein  41.35 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0263  peptide chain release factor-like protein  40 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0290  peptide chain release factor-like protein  40 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0268  peptide chain release factor-like protein  40 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0233  peptide chain release factor-like protein  40 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3597  peptide chain release factor-like protein  40.28 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01750  peptide chain release factor-like protein  40.78 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  0.46874 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4861  peptide chain release factor-like protein  42.57 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0755731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7272  peptide chain release factor-like protein  38.69 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000014386  normal  0.97905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3439  peptide chain release factor-like protein  39.81 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0760  peptide chain release factor H  28.16 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3371  peptide chain release factor H  38.95 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72200  peptide chain release factor-like protein  39.11 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00231  peptide chain release factor 2  41.18 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00234  hypothetical protein  41.18 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0281  peptide chain release factor-like protein  41.83 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2039  class I peptide chain release factor  39.79 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0332  putative peptide chain release factor  33.78 
 
 		 248 aa  111  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2459  peptide chain release factor H  36.87 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321859  normal  0.956081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3902  peptide chain release factor H  32.58 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0189567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0242  peptide chain release factor-like protein  37.5 
 
 		 219 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  39.69 
 
 		 349 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  38.17 
 
 		 349 aa  85.5  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  35 
 
 		 280 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  40 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0780  peptide chain release factor 1  47 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1151  peptide chain release factor 2  38.36 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0851  peptide chain release factor 1  47 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  40 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  39.2 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  33.54 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  39.2 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  39.2 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  39.2 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  39.2 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  37.25 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  38.46 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  34.36 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  39.2 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  39.2 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  37.88 
 
 		 367 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1766  peptide chain release factor 2  39.53 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  37.41 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5476  peptide chain release factor 1  47.27 
 
 		 360 aa  82  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  47.92 
 
 		 361 aa  82.4  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  35.76 
 
 		 361 aa  82  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  38.52 
 
 		 367 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  37.41 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  46.3 
 
 		 360 aa  82.4  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  34.73 
 
 		 366 aa  81.6  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  40.87 
 
 		 367 aa  81.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1847  peptide chain release factor 2  38.97 
 
 		 300 aa  81.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0723  peptide chain release factor 1  43 
 
 		 361 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.905014  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3664  peptide chain release factor 1  46 
 
 		 360 aa  81.3  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  60.61 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  44.44 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  33.54 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2027  peptide chain release factor 2  34.84 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  35.62 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  37.5 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  34.42 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  37.5 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0523  peptide chain release factor 1  47.52 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3548  class I peptide chain release factor  52.11 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00527639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  39.2 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  45.05 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  34.42 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  34.42 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  34.42 
 
 		 391 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  34.42 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  35.06 
 
 		 406 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  34.19 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3112  peptide chain release factor 2  34.19 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  34.42 
 
 		 391 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1479  peptide chain release factor 2, programmed  34.19 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  34.42 
 
 		 391 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  34.19 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  34.42 
 
 		 391 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 322 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  44.3 
 
 		 362 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  44.44 
 
 		 376 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  38.28 
 
 		 386 aa  78.2  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  39.84 
 
 		 363 aa  78.2  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 322 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  40.16 
 
 		 361 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0290  peptide chain release factor 1  45.88 
 
 		 366 aa  78.2  0.00000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.589593  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1554  peptide chain release factor 1  46 
 
 		 359 aa  78.2  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.438091  hitchhiker  0.00494588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  37.4 
 
 		 361 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  43.52 
 
 		 361 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3687  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 		 360 aa  77.8  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  44.32 
 
 		 330 aa  78.2  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  43.43 
 
 		 323 aa  78.2  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>