More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0742 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0742  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 257 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2499  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.29 
 
 		 279 aa  322  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6108  ABC transporter related  63.71 
 
 		 276 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.665492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4452  ABC transporter related  63.37 
 
 		 253 aa  320  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6520  ABC transporter related  63.29 
 
 		 276 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.510638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0610  ABC transporter related  63.03 
 
 		 268 aa  312  3.9999999999999997e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1591  ABC transporter related  59.92 
 
 		 263 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.963081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1364  ABC transporter related  62.5 
 
 		 289 aa  308  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.245091  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3976  ABC transporter related  62.87 
 
 		 257 aa  307  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1341  ABC transporter-like  60.42 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4534  ABC transporter related  59.92 
 
 		 263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3974  ABC transporter  61.25 
 
 		 260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2397  ABC transporter related  59.17 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1225  ABC transporter related  58.65 
 
 		 274 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2185  ABC transporter related  57.81 
 
 		 263 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.839848  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4240  ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2684  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 263 aa  295  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2358  ABC transporter related  59.17 
 
 		 246 aa  295  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.869822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0048  ABC transporter related  58.16 
 
 		 259 aa  291  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2603  ABC transporter related  56.96 
 
 		 256 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1889  ABC transporter related  58.72 
 
 		 257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1124  ABC transporter  56.9 
 
 		 267 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2730  ABC transporter related  57.32 
 
 		 280 aa  271  7e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3490  ABC transporter related  46.69 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.78 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.02 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.02 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  40.98 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.67 
 
 		 308 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  48.26 
 
 		 306 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.76 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.27 
 
 		 307 aa  178  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.08 
 
 		 258 aa  178  9e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  38.68 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  40.32 
 
 		 284 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  44.17 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  48.29 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.76 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  40.43 
 
 		 251 aa  174  9e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.28 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.28 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48.48 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.27 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.47 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.27 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.27 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  43.65 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  38.87 
 
 		 280 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  39.43 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.66 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  42.04 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.28 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  45.16 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3042  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.06 
 
 		 557 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.499138  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.37 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  44.44 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  42.86 
 
 		 319 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  42.86 
 
 		 319 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  46.32 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.35 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.52 
 
 		 663 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.35 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.54 
 
 		 668 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.54 
 
 		 668 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.07 
 
 		 273 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  42.79 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  46.77 
 
 		 286 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.36 
 
 		 348 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  43.32 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.04 
 
 		 668 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.28 
 
 		 669 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  44.6 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  40.85 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 		 355 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.28 
 
 		 669 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  42.22 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  42.22 
 
 		 319 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  43.6 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.33 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1823  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1838  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1723  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0781  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.78 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  44.55 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 354 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  45.45 
 
 		 315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  42.4 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1991  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 335 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0937962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  45.71 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.79 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.96 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>