More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0403 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.09 
 
 
471 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  69.51 
 
 
470 aa  676    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  67.38 
 
 
471 aa  652    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  69.51 
 
 
470 aa  677    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  68.16 
 
 
471 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  69.72 
 
 
470 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  68.59 
 
 
471 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  69.51 
 
 
471 aa  693    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  100 
 
 
472 aa  977    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  64.69 
 
 
477 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  61.88 
 
 
475 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.1 
 
 
475 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0893  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.74 
 
 
475 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.81 
 
 
475 aa  586  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4592  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  61.67 
 
 
475 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647978  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0812  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  61.24 
 
 
475 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  61.03 
 
 
474 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472355  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.55 
 
 
486 aa  558  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2236  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60 
 
 
471 aa  552  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0328346 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.17 
 
 
480 aa  542  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.5 
 
 
473 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.74 
 
 
476 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  56.75 
 
 
476 aa  535  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.61 
 
 
479 aa  536  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  56.71 
 
 
473 aa  538  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  55.97 
 
 
480 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  56.7 
 
 
473 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.68 
 
 
473 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  56.7 
 
 
473 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1223  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  55.36 
 
 
483 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3156  microcin-processing peptidase 2  56.64 
 
 
474 aa  508  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.702304 
 
 
-
 
NC_002978  WD0998  tldD protein  53.29 
 
 
472 aa  506  9.999999999999999e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  56.95 
 
 
479 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  54.22 
 
 
490 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  54.22 
 
 
480 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0152  tldD protein  52.55 
 
 
467 aa  488  1e-137  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  53.57 
 
 
480 aa  488  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  54.69 
 
 
481 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  52.37 
 
 
481 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  54.91 
 
 
481 aa  488  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.73 
 
 
496 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.64 
 
 
480 aa  487  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  53.39 
 
 
486 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0100  microcin-processing peptidase 2  52.6 
 
 
477 aa  483  1e-135  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.884188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  55.76 
 
 
480 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.56 
 
 
486 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  53.38 
 
 
481 aa  482  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  55.76 
 
 
480 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  53.39 
 
 
481 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  49.9 
 
 
483 aa  478  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.11 
 
 
487 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.57 
 
 
496 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.07 
 
 
480 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.67 
 
 
486 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  52.36 
 
 
484 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.75 
 
 
481 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.38 
 
 
486 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  52.35 
 
 
481 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  51.32 
 
 
481 aa  471  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.24 
 
 
481 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  52.35 
 
 
481 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  54.4 
 
 
479 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  53.88 
 
 
481 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  55.3 
 
 
480 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  54.24 
 
 
481 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  52.35 
 
 
481 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.57 
 
 
496 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  51.91 
 
 
493 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  54.69 
 
 
481 aa  474  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  52.77 
 
 
486 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  52.03 
 
 
486 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  52.35 
 
 
481 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.03 
 
 
486 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  52.35 
 
 
481 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.01 
 
 
487 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  52.35 
 
 
481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.35 
 
 
481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.86 
 
 
508 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  49.37 
 
 
481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  52.13 
 
 
498 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  52.35 
 
 
481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  52.35 
 
 
481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  50.75 
 
 
481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.59 
 
 
490 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  52.13 
 
 
481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  52.35 
 
 
481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  52.35 
 
 
481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  52.35 
 
 
481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  52.35 
 
 
481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  54.24 
 
 
486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.72 
 
 
479 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  53.72 
 
 
479 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  51.3 
 
 
481 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.5 
 
 
479 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.72 
 
 
479 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  54.48 
 
 
481 aa  465  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  51.45 
 
 
481 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  50.42 
 
 
481 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.99 
 
 
482 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.15 
 
 
481 aa  462  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>