More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_21980 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_21980  ABC transporter, ATP binding component  100 
 
 
271 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  57.98 
 
 
271 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  56.76 
 
 
276 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  50.19 
 
 
267 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 
260 aa  265  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.38 
 
 
260 aa  251  8.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.39 
 
 
267 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
261 aa  248  7e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.56 
 
 
253 aa  244  8e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0164  ABC transporter related  45.78 
 
 
275 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  52.21 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  50.89 
 
 
253 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.62 
 
 
254 aa  232  5e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.57 
 
 
251 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.07 
 
 
263 aa  227  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2790  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
268 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.02 
 
 
254 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  42.86 
 
 
304 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.39 
 
 
258 aa  224  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  44.32 
 
 
291 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.78 
 
 
254 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  44.89 
 
 
261 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  45.98 
 
 
267 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40.78 
 
 
254 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.3 
 
 
254 aa  222  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  46.37 
 
 
267 aa  221  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.4 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.58 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.48 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  46.37 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  47.81 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  43.09 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.93 
 
 
286 aa  218  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  44.49 
 
 
259 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.03 
 
 
253 aa  218  7e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  42.7 
 
 
303 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
264 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  42.26 
 
 
303 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  42.26 
 
 
303 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  43.12 
 
 
282 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  43.41 
 
 
263 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  44.98 
 
 
259 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  45.38 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.58 
 
 
260 aa  216  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  44.27 
 
 
263 aa  215  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 
311 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  45.6 
 
 
293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  48.89 
 
 
264 aa  215  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  45.06 
 
 
295 aa  215  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.58 
 
 
259 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  44.07 
 
 
259 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.27 
 
 
279 aa  214  9e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.02 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  47.37 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  45.61 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  41.44 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.9 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  45.6 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  44.89 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  44.31 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  44.07 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  46.38 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3789  ABC transporter related  45.24 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.860108  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  46.41 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  49.52 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.8 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 
311 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.26 
 
 
292 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.08 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  43.24 
 
 
272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  41.27 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  44.53 
 
 
269 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001609  nitrate ABC transporter ATP-binding protein  43.02 
 
 
278 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05590  hypothetical protein  43.02 
 
 
278 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  44.02 
 
 
246 aa  211  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  46.88 
 
 
264 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.69 
 
 
285 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.69 
 
 
285 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  45.9 
 
 
285 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  43.67 
 
 
286 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  44.54 
 
 
303 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  44.18 
 
 
272 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
308 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  48.36 
 
 
263 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  44.05 
 
 
276 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  48.91 
 
 
276 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
279 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.15 
 
 
288 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.64 
 
 
252 aa  209  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.9 
 
 
273 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  41.42 
 
 
307 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.49 
 
 
262 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  41.18 
 
 
272 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.06 
 
 
274 aa  209  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  40.32 
 
 
257 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
272 aa  209  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  43.33 
 
 
306 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 
272 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 
278 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>