124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_02420 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  65.2 
 
 		 230 aa  323  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  60.79 
 
 		 227 aa  297  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  57.71 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  59.47 
 
 		 232 aa  290  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  59.03 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  62.28 
 
 		 228 aa  288  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  59.47 
 
 		 232 aa  284  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  58.87 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  55.41 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  57.71 
 
 		 228 aa  275  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  55.22 
 
 		 231 aa  275  6e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  55.51 
 
 		 230 aa  271  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  55.31 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  53.91 
 
 		 238 aa  268  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  50.43 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  49.12 
 
 		 259 aa  228  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  46.19 
 
 		 232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  44.89 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  46.19 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  46.19 
 
 		 232 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  43.17 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  43.23 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  42.22 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  40.35 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  39.13 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  35.22 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  39.04 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  37.83 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  34.96 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  35.5 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  34.78 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  28.72 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  26.7 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  29.08 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  27.98 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  28.12 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4213  urease accessory protein UreG  29.94 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  27.89 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  30.14 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  27.6 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  28.11 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0830  urease accessory protein UreG  26.26 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0380  urease accessory protein UreG  24.21 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  27.37 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  25.91 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5119  urease accessory protein UreG  29.02 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  26.7 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  28.27 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  27.23 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  29.17 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  27.23 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  24.39 
 
 		 212 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2482  hydrogenase accessory protein HypB  39.73 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  28.57 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1302  urease accessory protein UreG  29.02 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1464  urease accessory protein UreG  29.02 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4911  urease accessory protein UreG  34.55 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4453  urease accessory protein UreG  34.86 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  26.32 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0561  urease accessory protein UreG  33.64 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562305  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  27.03 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  24.46 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  26.56 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08891  urease accessory protein UreG  23.62 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1684  urease accessory protein UreG  25.71 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  35.65 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  27.37 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  27.68 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  25.57 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  25.57 
 
 		 281 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2302  urease accessory protein UreG  27.23 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1317  urease accessory protein UreG  28.57 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  27.31 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  26.84 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  26.84 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  25.79 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  28.08 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0585  urease accessory protein UreG  26.18 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.084211 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  25.77 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0723  urease accessory protein UreG  28 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  26.67 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0058  urease accessory protein UreG  26.56 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2990  urease accessory protein UreG  26.32 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.386954  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3468  urease accessory protein UreG  26.56 
 
 		 203 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2187  urease accessory protein UreG  27.37 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0720  urease accessory protein UreG  27.37 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2554  urease accessory protein UreG  27.37 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3079  urease accessory protein UreG  27.37 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3115  urease accessory protein UreG  27.37 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2060  urease accessory protein UreG  27.37 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  25.65 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1263  urease accessory protein  23.71 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08871  urease accessory protein UreG  23.74 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  26.94 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  26.94 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  26.94 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  26.18 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2849  urease accessory protein UreG  26.52 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3138  urease accessory protein UreG  27.37 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>