More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7269 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1454  ABC peptide/nickel/opine transporter, fused ATPase subunits  58.02 
 
 		 617 aa  697    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27378  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4009  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  68.89 
 
 		 615 aa  850    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.33913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2593  ABC transporter ATP-binding protein  78.02 
 
 		 608 aa  961    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3753  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  70.4 
 
 		 612 aa  854    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0979148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4048  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  70.23 
 
 		 612 aa  851    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.821009  normal  0.479182 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7269  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 614 aa  1250    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0103  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.02 
 
 		 617 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0117419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  39.62 
 
 		 619 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.51 
 
 		 617 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.96 
 
 		 620 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  35.88 
 
 		 609 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  36.02 
 
 		 610 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  37.52 
 
 		 593 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  37.27 
 
 		 611 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  38.67 
 
 		 550 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  40.11 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  38.69 
 
 		 613 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  38.8 
 
 		 613 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 		 623 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 601 aa  364  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  36.3 
 
 		 615 aa  363  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  35.11 
 
 		 564 aa  362  8e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  36.29 
 
 		 612 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  37.77 
 
 		 573 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  37.46 
 
 		 611 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  36.01 
 
 		 619 aa  360  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  38.1 
 
 		 592 aa  360  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.61 
 
 		 629 aa  359  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.91 
 
 		 611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  37.29 
 
 		 640 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  37.45 
 
 		 571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.03 
 
 		 625 aa  358  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 623 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  38.1 
 
 		 592 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.35 
 
 		 626 aa  356  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  36.92 
 
 		 623 aa  356  7.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.26 
 
 		 629 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  35.78 
 
 		 640 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.89 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  37.92 
 
 		 592 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  38.03 
 
 		 633 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.31 
 
 		 649 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  36.03 
 
 		 593 aa  353  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.01 
 
 		 634 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.18 
 
 		 625 aa  353  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  36.28 
 
 		 597 aa  352  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  38.67 
 
 		 573 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  35.65 
 
 		 599 aa  351  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  40.07 
 
 		 551 aa  351  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  37.13 
 
 		 588 aa  350  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 541 aa  350  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  37.44 
 
 		 630 aa  350  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.16 
 
 		 632 aa  350  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.67 
 
 		 634 aa  350  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 		 634 aa  350  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  37.23 
 
 		 569 aa  349  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 601 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 		 539 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  36.94 
 
 		 611 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.09 
 
 		 633 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  38.33 
 
 		 549 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  36.25 
 
 		 611 aa  347  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  36.93 
 
 		 586 aa  347  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  35.63 
 
 		 522 aa  347  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  37.26 
 
 		 627 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.19 
 
 		 596 aa  345  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  37.34 
 
 		 549 aa  345  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  39.32 
 
 		 549 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 		 539 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 565 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  40 
 
 		 534 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.44 
 
 		 612 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  36.44 
 
 		 612 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 		 623 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 623 aa  343  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 		 623 aa  343  5e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 		 623 aa  343  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  37.74 
 
 		 537 aa  343  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  35.81 
 
 		 640 aa  343  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  36.7 
 
 		 561 aa  342  8e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  39.55 
 
 		 549 aa  342  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  38.88 
 
 		 556 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 		 623 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  37.19 
 
 		 538 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  36.29 
 
 		 632 aa  342  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  37.77 
 
 		 631 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 		 629 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 		 623 aa  342  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  37.38 
 
 		 537 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  37.05 
 
 		 624 aa  341  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  37.22 
 
 		 530 aa  341  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  36.75 
 
 		 619 aa  341  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  37.27 
 
 		 546 aa  342  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  36.66 
 
 		 595 aa  341  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  36.65 
 
 		 570 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  33.78 
 
 		 606 aa  340  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.82 
 
 		 633 aa  340  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  38.95 
 
 		 531 aa  340  5e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.9 
 
 		 531 aa  340  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  35.28 
 
 		 623 aa  340  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>