120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5926 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  100 
 
 		 310 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  55.84 
 
 		 309 aa  358  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  53.33 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  47.16 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  47 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  46.33 
 
 		 326 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  44.67 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3221  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.452086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  36.65 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2973  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 		 326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  29.81 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  33.91 
 
 		 642 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4592  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1005  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150967 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1352  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.82 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.82 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2751  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.91 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.83 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  23.21 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  25 
 
 		 1065 aa  59.7  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  25.4 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4238  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  23.77 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  23.29 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  24.84 
 
 		 1041 aa  53.1  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0107  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.53 
 
 		 330 aa  52.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 328 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 344 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 344 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0097  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  22.96 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  22.71 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4197  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  24.39 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  28.69 
 
 		 754 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0289  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 		 329 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  23.51 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  22.95 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5508  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164497  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5280  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5124  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5677  group 2 family glycosyl transferase  31.58 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  22.27 
 
 		 1119 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5523  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  24 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  23.84 
 
 		 314 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.79 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.36 
 
 		 326 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 		 326 aa  46.2  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 477 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.79 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 342 aa  45.8  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 310 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 		 680 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  30.1 
 
 		 501 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  20.71 
 
 		 573 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  20.71 
 
 		 573 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 454 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>