43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1485 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  100 
 
 		 81 aa  158  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  58.97 
 
 		 78 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  54.29 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  56.79 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  53.09 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  57.14 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  57.14 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  49.38 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  48.57 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  44.05 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  48.65 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  49.35 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  50 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.05 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.77 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  59.62 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.75 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  40.54 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.31 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  43.08 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  42.86 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  40 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.81 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  37.1 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  57.5 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  47.5 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  30.77 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  32.31 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  40.35 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.54 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  44.44 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  39.19 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  33.33 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3463  virulence-associated protein-like protein  33.33 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  36.07 
 
 		 87 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  33.96 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  35.42 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  40.74 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  33.96 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0067  SpoVT/AbrB domain protein  36.36 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.92 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.92 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>