44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3056 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3056  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1021 aa  2107    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1772  WD repeat-containing protein  30.5 
 
 		 981 aa  99  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  27.13 
 
 		 438 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.04 
 
 		 782 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  21.22 
 
 		 1238 aa  66.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.97 
 
 		 1009 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.78 
 
 		 1208 aa  58.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  21.8 
 
 		 1209 aa  55.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 		 991 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 		 1526 aa  55.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  23.43 
 
 		 915 aa  55.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  25.56 
 
 		 996 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1025 aa  53.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 1285 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.56 
 
 		 1188 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  20.36 
 
 		 828 aa  52.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1190 aa  52  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  22.97 
 
 		 1914 aa  51.6  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.68 
 
 		 868 aa  50.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.23 
 
 		 1186 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.65 
 
 		 1266 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 1060 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 1071 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 568 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.31 
 
 		 568 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  22.75 
 
 		 745 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 1714 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  22.76 
 
 		 1213 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  26.28 
 
 		 830 aa  48.5  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  25.23 
 
 		 464 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  22.11 
 
 		 957 aa  48.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 809 aa  47.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 901 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  21.55 
 
 		 1411 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 775 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  22.45 
 
 		 672 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 343 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1298 aa  47  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 1221 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  22.53 
 
 		 838 aa  45.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2310  diguanylate cyclase  24.79 
 
 		 718 aa  45.4  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 768 aa  44.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  20.08 
 
 		 1180 aa  44.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1028 aa  44.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>