More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1511 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1511  ribonuclease H  100 
 
 		 302 aa  628  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0428  ribonuclease H  75.5 
 
 		 302 aa  457  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  52.26 
 
 		 259 aa  288  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  68 
 
 		 157 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2151  ribonuclease HI  35.66 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27831  ribonuclease HI  35.34 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2466  RNase HI  35.82 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1567  ribonuclease HI  48.3 
 
 		 161 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02761  ribonuclease HI  48.3 
 
 		 161 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.175549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  52.41 
 
 		 154 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02181  ribonuclease HI  49.3 
 
 		 163 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.959518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  51.05 
 
 		 160 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  43.79 
 
 		 527 aa  143  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.59 
 
 		 532 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1014  ribonuclease H  45.7 
 
 		 214 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  49.32 
 
 		 149 aa  142  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  50.37 
 
 		 142 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  50.7 
 
 		 153 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  49.31 
 
 		 161 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  50 
 
 		 150 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  50.72 
 
 		 154 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4615  hypothetical protein  73.91 
 
 		 91 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0227582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  47.45 
 
 		 162 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  48.61 
 
 		 156 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  45.89 
 
 		 163 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  47.92 
 
 		 155 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  50.37 
 
 		 148 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  49.29 
 
 		 151 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  49.64 
 
 		 153 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  50.37 
 
 		 148 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2115  RNase HI  50 
 
 		 238 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  51.09 
 
 		 150 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2205  ribonuclease H  47.18 
 
 		 157 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0167924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  49.26 
 
 		 153 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  49.63 
 
 		 160 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  46 
 
 		 154 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  46.76 
 
 		 154 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  46.72 
 
 		 154 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  45.14 
 
 		 149 aa  132  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  50 
 
 		 156 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  48.89 
 
 		 153 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  48.55 
 
 		 148 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  44.16 
 
 		 150 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  47.41 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  46.26 
 
 		 153 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  48.55 
 
 		 148 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  47.89 
 
 		 155 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  50.37 
 
 		 147 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  46.31 
 
 		 157 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  49.26 
 
 		 154 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  45.39 
 
 		 154 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  48.59 
 
 		 175 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  45.26 
 
 		 151 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  46.32 
 
 		 145 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  45.21 
 
 		 223 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  45.45 
 
 		 161 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  45.83 
 
 		 161 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  48.89 
 
 		 143 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  47.06 
 
 		 153 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  47.89 
 
 		 151 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  45.59 
 
 		 154 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  45.07 
 
 		 156 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  45.07 
 
 		 156 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  45.07 
 
 		 156 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  45.59 
 
 		 154 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  45.89 
 
 		 225 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  45.07 
 
 		 156 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  49.65 
 
 		 154 aa  129  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  50.35 
 
 		 154 aa  129  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  48.18 
 
 		 150 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  48.53 
 
 		 151 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  48.18 
 
 		 149 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  47.45 
 
 		 159 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  49.29 
 
 		 157 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  47.06 
 
 		 158 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  47.89 
 
 		 151 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  45.45 
 
 		 185 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  45.83 
 
 		 156 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  47.41 
 
 		 148 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  46.72 
 
 		 148 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  46.32 
 
 		 151 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  48.53 
 
 		 151 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0483  ribonuclease H  47.62 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  45.52 
 
 		 159 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  44.6 
 
 		 156 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  48.51 
 
 		 146 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  46.32 
 
 		 156 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6005  ribonuclease H  46.27 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.266469  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  47.45 
 
 		 149 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  45.32 
 
 		 147 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  46.1 
 
 		 150 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  48.18 
 
 		 155 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  45.32 
 
 		 158 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  43.84 
 
 		 163 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  45.89 
 
 		 148 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  47.41 
 
 		 145 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  43.06 
 
 		 235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  46.81 
 
 		 157 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  45.32 
 
 		 158 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  45.32 
 
 		 158 aa  126  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>