38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1328 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  100 
 
 		 1159 aa  2389    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  71.24 
 
 		 1131 aa  1662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  37.8 
 
 		 1188 aa  632  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  37.76 
 
 		 1323 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  35.34 
 
 		 1332 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  36.13 
 
 		 1285 aa  594  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  35.68 
 
 		 1062 aa  584  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  35.29 
 
 		 1339 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  35.59 
 
 		 1101 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  36.05 
 
 		 1321 aa  572  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  36.27 
 
 		 1314 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  34.07 
 
 		 1220 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  34.07 
 
 		 1220 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  33.73 
 
 		 1235 aa  551  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  35.3 
 
 		 1287 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  35.38 
 
 		 1226 aa  551  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  33.28 
 
 		 1254 aa  544  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  33.41 
 
 		 1374 aa  534  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  33.07 
 
 		 1252 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  31.96 
 
 		 1071 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  33.56 
 
 		 1173 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  36.13 
 
 		 1063 aa  419  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  32.06 
 
 		 1215 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  32.92 
 
 		 1162 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  32.57 
 
 		 1201 aa  271  5.9999999999999995e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  25.83 
 
 		 1410 aa  199  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  28.37 
 
 		 1401 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  28.37 
 
 		 1401 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  26.16 
 
 		 1424 aa  194  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  27.44 
 
 		 1189 aa  180  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  25.37 
 
 		 1082 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.83 
 
 		 775 aa  54.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.14 
 
 		 589 aa  51.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.31 
 
 		 768 aa  49.7  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  28.57 
 
 		 795 aa  49.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.49 
 
 		 868 aa  45.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.72 
 
 		 781 aa  45.1  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15057  predicted protein  37.33 
 
 		 654 aa  45.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>