57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1225 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1225  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 100 aa  201  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2857  transcriptional regulator, PadR-like family  89.9 
 
 		 100 aa  184  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2227  PadR family transcriptional regulator  67 
 
 		 101 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3107  transcriptional regulator, PadR-like family  58.16 
 
 		 103 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4665  PadR-like family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4772  PadR-like family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1141  transcriptional regulator, PadR family  45.83 
 
 		 102 aa  94.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  44.9 
 
 		 99 aa  91.3  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0613  PadR-like family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0730  PadR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.118827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4437  transcriptional regulator, PadR-like family  46.88 
 
 		 97 aa  87  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873187 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2202  PadR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2348  PadR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2060  PadR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  44.21 
 
 		 107 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1435  PadR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.666797 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0216  PadR-like family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2687  PadR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  31.25 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 372 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5527  PadR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  29.33 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  34.41 
 
 		 250 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5749  putative PadR-like family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  36.56 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  35.37 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  32.99 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  30 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  38.67 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 250 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  30.56 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 237 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 237 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 236 aa  40  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 121 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  38.67 
 
 		 123 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 237 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 237 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 237 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 156 aa  40  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>