More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1532 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  100 
 
 		 174 aa  347  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  65.32 
 
 		 177 aa  229  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  61.05 
 
 		 172 aa  214  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  61.54 
 
 		 174 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  57.47 
 
 		 173 aa  210  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  57.47 
 
 		 173 aa  210  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  52.91 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  53.8 
 
 		 172 aa  185  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  48.28 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  52.05 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  46.67 
 
 		 243 aa  176  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  49.42 
 
 		 174 aa  175  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  51.14 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  47.37 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  47.51 
 
 		 181 aa  175  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  49.14 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  49.14 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  49.71 
 
 		 178 aa  171  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  51.15 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  48.57 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  53.49 
 
 		 175 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  51.15 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  51.15 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  51.15 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  51.15 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  51.15 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  51.15 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  51.15 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  51.15 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  49.43 
 
 		 176 aa  167  9e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  50.57 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  47.46 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  52.33 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  50 
 
 		 181 aa  164  4e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  47.13 
 
 		 177 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  46.89 
 
 		 194 aa  164  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  42.16 
 
 		 272 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  47.95 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  47.65 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  50.57 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  45.98 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  46.29 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  47.16 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  49.17 
 
 		 185 aa  160  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  41.12 
 
 		 266 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  42.56 
 
 		 276 aa  159  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  42.62 
 
 		 266 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  41.99 
 
 		 277 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 272 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  46.51 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  45.3 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  41.99 
 
 		 273 aa  157  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  40.56 
 
 		 266 aa  157  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1148  NusG antitermination factor  42.44 
 
 		 207 aa  156  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000795097  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  37.95 
 
 		 270 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  37.95 
 
 		 270 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  42.86 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  41.15 
 
 		 299 aa  154  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  37.44 
 
 		 271 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  42.13 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  40.4 
 
 		 238 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  40.96 
 
 		 267 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  46.07 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  41.99 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1492  NusG antitermination factor  42.86 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.509367  normal  0.372591 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  41.34 
 
 		 180 aa  151  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  41.44 
 
 		 250 aa  150  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  45.51 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  41.27 
 
 		 273 aa  150  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  44 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  42.7 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  41.28 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  40.66 
 
 		 246 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  42.78 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  46.29 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  42.7 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  40.91 
 
 		 178 aa  147  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1765  transcription antitermination protein NusG  41.49 
 
 		 208 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000435083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1741  transcription antitermination protein NusG  41.49 
 
 		 208 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  38.66 
 
 		 265 aa  147  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  41.71 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  41.71 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  38.46 
 
 		 317 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  41.71 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  41.9 
 
 		 242 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  41.71 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  39.38 
 
 		 306 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  42.29 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  41.71 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  42.29 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  40.57 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  41.9 
 
 		 242 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  43.32 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  44.2 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  43.32 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  43.32 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  43.32 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  43.32 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  43.32 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  43.32 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>