50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4400 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  100 
 
 
88 aa  183  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  84.71 
 
 
90 aa  152  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  49.38 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  41.03 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.86 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  43.42 
 
 
74 aa  65.5  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  39.74 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  42.31 
 
 
82 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  37.18 
 
 
73 aa  63.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.31 
 
 
73 aa  62.8  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  37.18 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  40.51 
 
 
77 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  35.9 
 
 
73 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  39.74 
 
 
73 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  37.04 
 
 
76 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  38.46 
 
 
73 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  38.46 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  34.18 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  34.18 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  36 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  34.18 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  40.79 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  35.9 
 
 
73 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  37.5 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  36.25 
 
 
79 aa  57  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  34.62 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  42.47 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  35.37 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  39.74 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  37.5 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  37.5 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  38.16 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  38.16 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  38.16 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  38.67 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.49 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  35.9 
 
 
79 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  38.16 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.18 
 
 
74 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  32.56 
 
 
80 aa  53.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  39.74 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  44.44 
 
 
84 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  32.05 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  35.44 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  41.27 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  39.29 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  39.29 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  38.33 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  39.34 
 
 
194 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.14 
 
 
81 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>