More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2619 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 357 aa  725    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  95.52 
 
 		 357 aa  697    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  70.14 
 
 		 361 aa  491  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  66.57 
 
 		 356 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  68.82 
 
 		 373 aa  472  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  64.04 
 
 		 357 aa  472  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  69.55 
 
 		 369 aa  465  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  68.42 
 
 		 366 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09920  peptide chain release factor 1  71.59 
 
 		 361 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  65.99 
 
 		 364 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  64.94 
 
 		 355 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  65.09 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  62.82 
 
 		 350 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  62.36 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  61.89 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  61.89 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  61.89 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2101  peptide chain release factor 1  62.61 
 
 		 361 aa  421  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015284  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 		 365 aa  420  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1304  peptide chain release factor 1  60.11 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  61.02 
 
 		 350 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  60.74 
 
 		 357 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  64.27 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  62.35 
 
 		 357 aa  411  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1061  peptide chain release factor 1  67.83 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.742793  normal  0.892078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  57.95 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  58 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  60.57 
 
 		 358 aa  408  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1010  peptide chain release factor 1  59.44 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1257  peptide chain release factor 1  67.23 
 
 		 355 aa  404  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626202  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1236  peptide chain release factor 1  59.04 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417509  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  62.72 
 
 		 362 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2307  peptide chain release factor 1  61.05 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  63.31 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1909  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 364 aa  378  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 378 aa  371  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  48.76 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  47.5 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  47.5 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  50.3 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 358 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 358 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 358 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 358 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 358 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  47.5 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1808  peptide chain release factor 1  52.29 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 355 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  48.18 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 355 aa  338  9e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  48.41 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  48.41 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  47.49 
 
 		 361 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  48.13 
 
 		 357 aa  335  5e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  48.84 
 
 		 355 aa  335  5.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  49.03 
 
 		 358 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 357 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 355 aa  334  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 		 359 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  46.69 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  45.6 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  47.69 
 
 		 356 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  47.65 
 
 		 361 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  45.43 
 
 		 353 aa  332  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 359 aa  332  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 360 aa  332  5e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  46.69 
 
 		 362 aa  332  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 358 aa  332  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 358 aa  332  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 361 aa  332  8e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2072  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  46.28 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  46.43 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  47.7 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  47.11 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 355 aa  329  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  46.65 
 
 		 361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  47.12 
 
 		 357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  45.81 
 
 		 361 aa  328  6e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 361 aa  328  8e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  45.86 
 
 		 362 aa  328  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  46.13 
 
 		 355 aa  328  9e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  48.41 
 
 		 356 aa  328  9e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  51.79 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  50.45 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  48.68 
 
 		 363 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  47.27 
 
 		 360 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 363 aa  327  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  49.17 
 
 		 361 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1607  peptide chain release factor 1  45.98 
 
 		 363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317089  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  51.06 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>