41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0387 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  100 
 
 
296 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  79.63 
 
 
293 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  62.88 
 
 
294 aa  315  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  46.08 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  41.13 
 
 
286 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  49.06 
 
 
300 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  47.59 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  45.27 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  44.44 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  37.6 
 
 
294 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  32.1 
 
 
316 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  33.97 
 
 
327 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  33.95 
 
 
314 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  32.99 
 
 
292 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  37.91 
 
 
288 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1205  ABC transporter integral membrane protein  36.09 
 
 
266 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  30.74 
 
 
288 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  28.98 
 
 
307 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  31.12 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  30.34 
 
 
317 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  31.35 
 
 
296 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  29.41 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  28.01 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  30.11 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  30.42 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6156  hypothetical protein  29.15 
 
 
457 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416994  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1810  bacitracin transport permease protein BcrB  31.3 
 
 
326 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  40 
 
 
326 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  27.69 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  38.33 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 
330 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5192  bacitracin transport permease protein BCRB  45.45 
 
 
330 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 
330 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  45.45 
 
 
330 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5649  ABC transporter permease  45.45 
 
 
330 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  31.33 
 
 
775 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5080  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  45.45 
 
 
330 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0496537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5251  ABC transporter permease  45.45 
 
 
330 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5494  ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 
330 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>