More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1404 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  100 
 
 
370 aa  744    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  57.77 
 
 
377 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  57.49 
 
 
377 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  57.22 
 
 
377 aa  421  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  57.22 
 
 
377 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  57.22 
 
 
377 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  57.22 
 
 
377 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  57.22 
 
 
377 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  57.22 
 
 
377 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  56.4 
 
 
377 aa  418  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  57.22 
 
 
377 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  57.22 
 
 
377 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  57.53 
 
 
377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  57.26 
 
 
377 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  57.26 
 
 
377 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  57.26 
 
 
377 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  56.99 
 
 
377 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  57.26 
 
 
377 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  55.56 
 
 
372 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  57.26 
 
 
377 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  57.26 
 
 
377 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  56.99 
 
 
377 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  57.26 
 
 
377 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  55.89 
 
 
373 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  57.26 
 
 
377 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  57.22 
 
 
374 aa  408  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  56.99 
 
 
377 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  61.1 
 
 
373 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  56.16 
 
 
372 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  56.16 
 
 
372 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  52.85 
 
 
371 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  60 
 
 
373 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  58.9 
 
 
373 aa  390  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  59.94 
 
 
373 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  55.71 
 
 
374 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  56.16 
 
 
371 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  55.89 
 
 
377 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  53.07 
 
 
371 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  51.36 
 
 
390 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 
373 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  51.5 
 
 
371 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  51.5 
 
 
371 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  52.78 
 
 
371 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  51.77 
 
 
371 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  52.63 
 
 
372 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  54.08 
 
 
371 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  51.49 
 
 
370 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  53.13 
 
 
377 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  56.91 
 
 
370 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  53.26 
 
 
371 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  52.04 
 
 
373 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  50.68 
 
 
372 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  52.45 
 
 
371 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  50.41 
 
 
376 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  48.64 
 
 
367 aa  368  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  49.32 
 
 
371 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  52.59 
 
 
371 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 
372 aa  364  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  50.27 
 
 
370 aa  363  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  50 
 
 
366 aa  363  3e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  54.35 
 
 
374 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  50.42 
 
 
363 aa  358  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  50.42 
 
 
363 aa  358  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3803  alanine dehydrogenase  54.29 
 
 
372 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  52.04 
 
 
370 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  49.18 
 
 
371 aa  357  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  52.04 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  53.55 
 
 
371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  56.38 
 
 
341 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  50.41 
 
 
372 aa  356  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  49.44 
 
 
366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  51.77 
 
 
370 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  50 
 
 
369 aa  355  6.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  49.44 
 
 
371 aa  355  7.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  51.82 
 
 
362 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  51.37 
 
 
371 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  51.64 
 
 
371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  51.91 
 
 
371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  51.49 
 
 
371 aa  352  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  50.83 
 
 
374 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4012  L-alanine dehydrogenase  53.74 
 
 
372 aa  353  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  48.06 
 
 
373 aa  353  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  51.5 
 
 
370 aa  352  5e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  49.46 
 
 
371 aa  352  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  51.23 
 
 
373 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  51.78 
 
 
371 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  51.64 
 
 
370 aa  351  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1744  L-alanine dehydrogenase  53.46 
 
 
372 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00361156  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  54.22 
 
 
368 aa  350  3e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  50.95 
 
 
371 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  50.82 
 
 
371 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  50.82 
 
 
371 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  50.82 
 
 
371 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  51.51 
 
 
371 aa  349  4e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  51.51 
 
 
371 aa  349  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  46.99 
 
 
367 aa  349  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5117  alanine dehydrogenase  51.62 
 
 
374 aa  348  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564204  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  50.82 
 
 
376 aa  348  7e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  51.51 
 
 
371 aa  348  9e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  50.96 
 
 
373 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>