More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2149 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2149  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0529153 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0323  transcriptional regulator, LysR family  76.62 
 
 		 323 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.712215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0334  transcriptional regulator, LysR family  76.3 
 
 		 323 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.937617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0312  LysR family transcriptional regulator  76.87 
 
 		 323 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  43.37 
 
 		 296 aa  228  8e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.86 
 
 		 302 aa  228  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  43.01 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.86 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  45.21 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  44.33 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.33 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  44.33 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  44.33 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.33 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.33 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.18 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.18 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.33 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.18 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.33 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0036  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  42.12 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.33 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.52 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.03 
 
 		 305 aa  222  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.69 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.69 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.69 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.69 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.69 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.52 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0334  LysR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4222  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79182  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2714  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.24 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2782  LysR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2425  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 308 aa  218  8.999999999999998e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.540189  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002320  Transcriptional regulator, LysR family  41.61 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.726256  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  41.38 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6567  hydrogen peroxide-inducible genes activator protein  46.03 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.222143  hitchhiker  0.00672743 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  41.38 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4881  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.24 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  45.05 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  43.58 
 
 		 301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2432  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3497  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  38.62 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.794623  hitchhiker  0.0000380526 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0001  LysR substrate binding domain protein  39.93 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000100891 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.78 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0871  oxidative stress transcriptional regulator  44.56 
 
 		 311 aa  208  9e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000180312  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0783  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33611  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2140  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.828195  normal  0.0106328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2864  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5771  transcriptional regulator LysR family  41.88 
 
 		 307 aa  205  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2079  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1346  LysR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4718  hydrogen peroxide-inducible genes activator  39.86 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04591  oxidative stress transcriptional regulator  44.9 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 320 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1798  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0382  LysR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 317 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0687  transcriptional regulator, LysR family  45.58 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0724  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0631  LysR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 311 aa  198  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808562  normal  0.903361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0434  transcriptional regulator, LysR family  39.67 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351851  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3588  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0969  transcriptional regulator, LysR family  45.3 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256112 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2792  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1585  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4242  transcriptional regulator, LysR family  45.67 
 
 		 309 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2217  LysR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 324 aa  192  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.335771  normal  0.670692 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1336  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0531475  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3406  transcriptional regulator, LysR family  43.43 
 
 		 336 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0354  transcriptional regulator OxyR  39.39 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.241733  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  40.75 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0029  regulatory protein, LysR  42.61 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4725  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1375  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5250  transcriptional regulator, LysR family  45.15 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0362  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0321  transcriptional regulator OxyR  39.39 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0036  LysR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3211  LysR substrate-binding  43.1 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.847319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3535  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0665  putative transcriptional regulator OxyR  40.75 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6388  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2322  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4681  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.468795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1241  transcriptional regulator, LysR family  40.84 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1816  transcriptional regulator, LysR family  44.84 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4389  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 301 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3053  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1919  LysR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.156623  normal  0.456297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1077  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0639  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 319 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3286  LysR family transcriptional regulator  44.82 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254644  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0020  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2381  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128975  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3802  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.238076  normal  0.337014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>