More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0705 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0705  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
523 aa  1072    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.65 
 
 
527 aa  250  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3486  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.42 
 
 
531 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.158391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3192  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.72 
 
 
531 aa  246  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.08 
 
 
531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1760  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.87 
 
 
531 aa  240  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  30.64 
 
 
525 aa  239  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.72 
 
 
529 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3100  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.47 
 
 
525 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.659114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.61 
 
 
534 aa  239  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  30.81 
 
 
524 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.51 
 
 
531 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.97 
 
 
529 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.4 
 
 
529 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.4 
 
 
529 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2680  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.1 
 
 
540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1543  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.88 
 
 
527 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00623773  hitchhiker  0.0000362163 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15401  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.43 
 
 
528 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0931759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2827  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.1 
 
 
546 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.91 
 
 
529 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6798  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.65 
 
 
531 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.48 
 
 
527 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.06 
 
 
526 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1352  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32 
 
 
534 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2506  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.21 
 
 
528 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000305441 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32 
 
 
531 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0263  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.9 
 
 
524 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.03617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.1 
 
 
525 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0567  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.22 
 
 
523 aa  231  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.1 
 
 
525 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.85 
 
 
528 aa  230  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3161  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.34 
 
 
532 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15551  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.83 
 
 
528 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4778  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.73 
 
 
527 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.3 
 
 
523 aa  230  6e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1202  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.82 
 
 
528 aa  229  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661102  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2138  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.62 
 
 
525 aa  229  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.91 
 
 
523 aa  229  9e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.56 
 
 
531 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1452  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.76 
 
 
528 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0271  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.16 
 
 
524 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.353808  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1084  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.47 
 
 
524 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2650  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.38 
 
 
528 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.93 
 
 
523 aa  226  7e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  30.81 
 
 
529 aa  226  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.99 
 
 
526 aa  226  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3620  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  30.22 
 
 
525 aa  226  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.737909  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3318  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.48 
 
 
531 aa  226  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1229  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.26 
 
 
533 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.59 
 
 
525 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.66 
 
 
652 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.24 
 
 
531 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570425  hitchhiker  0.00544887 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.17 
 
 
529 aa  224  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.23 
 
 
527 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1737  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.27 
 
 
541 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0639  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.95 
 
 
535 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.295873 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.91 
 
 
527 aa  223  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6394  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.15 
 
 
531 aa  223  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_004310  BR1685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.71 
 
 
533 aa  223  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447631  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1629  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.71 
 
 
533 aa  223  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3021  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.57 
 
 
531 aa  223  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3649  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.11 
 
 
526 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0277903  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1436  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.96 
 
 
524 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0672  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.64 
 
 
535 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0431754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0660  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.44 
 
 
535 aa  220  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  30.67 
 
 
529 aa  220  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119542  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1376  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.36 
 
 
528 aa  219  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.17 
 
 
523 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.97 
 
 
523 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1119  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.46 
 
 
529 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.63 
 
 
532 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.09 
 
 
526 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1501  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.55 
 
 
546 aa  217  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4106  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.82 
 
 
529 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885327  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1961  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  29.7 
 
 
532 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.829673  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05241  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.85 
 
 
528 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2256  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  29.49 
 
 
532 aa  216  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.5 
 
 
528 aa  216  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3860  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  30.84 
 
 
539 aa  216  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000678395  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2856  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.66 
 
 
528 aa  216  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2156  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.19 
 
 
526 aa  214  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1262  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.8 
 
 
528 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2694  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.4 
 
 
528 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1089  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.14 
 
 
526 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2601  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.6 
 
 
528 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  30.64 
 
 
531 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.55 
 
 
525 aa  212  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4312  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.02 
 
 
533 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0926  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.34 
 
 
528 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1018  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.42 
 
 
527 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000612711 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0896  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.42 
 
 
527 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643854  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0793  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  30.83 
 
 
529 aa  211  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3759  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.66 
 
 
526 aa  210  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.34 
 
 
528 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.877269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2813  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.84 
 
 
532 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4467  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.36 
 
 
526 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0468875  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14091  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.46 
 
 
528 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.187324  normal  0.0498894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11540  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.44 
 
 
527 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00507142  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0967  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.9 
 
 
526 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1198  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  28.94 
 
 
542 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0190635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>