More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0967 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  61.98 
 
 
538 aa  672    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1520  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  81.75 
 
 
526 aa  896    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0002199  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1089  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  81.94 
 
 
526 aa  891    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0967  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
526 aa  1071    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.59 
 
 
527 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.15 
 
 
527 aa  420  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.31 
 
 
526 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.05 
 
 
526 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1543  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.83 
 
 
527 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00623773  hitchhiker  0.0000362163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3649  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.76 
 
 
526 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0277903  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2506  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.58 
 
 
528 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000305441 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.97 
 
 
534 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.18 
 
 
523 aa  396  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.917938  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2650  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.89 
 
 
528 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.27 
 
 
529 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1262  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.21 
 
 
528 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2694  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.41 
 
 
528 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2601  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.41 
 
 
528 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159181  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0896  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.6 
 
 
527 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643854  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.42 
 
 
532 aa  385  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.97 
 
 
525 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1018  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.6 
 
 
527 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000612711 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.84 
 
 
531 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2138  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.57 
 
 
525 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1436  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.08 
 
 
524 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2680  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.93 
 
 
540 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1423  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.08 
 
 
527 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.23 
 
 
523 aa  378  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1501  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.37 
 
 
546 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.73 
 
 
528 aa  378  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1202  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.98 
 
 
528 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661102  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2827  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.24 
 
 
546 aa  375  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3161  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.49 
 
 
532 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.51 
 
 
525 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1760  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.88 
 
 
531 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2150  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40 
 
 
528 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204731  normal  0.434509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2813  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.09 
 
 
532 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.85 
 
 
528 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0259  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.53 
 
 
529 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.05 
 
 
525 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.42 
 
 
529 aa  372  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.85 
 
 
529 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.1 
 
 
527 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0527  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.5 
 
 
528 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.209223  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0786  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.81 
 
 
527 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4106  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.61 
 
 
529 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885327  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11540  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.86 
 
 
527 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00507142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.52 
 
 
526 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.19 
 
 
525 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.19 
 
 
523 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.19 
 
 
525 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4467  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.19 
 
 
526 aa  369  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0468875  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.7 
 
 
652 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3486  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.7 
 
 
531 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.158391 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05241  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.5 
 
 
528 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.9 
 
 
529 aa  363  4e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.31 
 
 
524 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2156  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.11 
 
 
526 aa  362  8e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.35 
 
 
529 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.57 
 
 
525 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.09 
 
 
529 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0639  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.2 
 
 
535 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.295873 
 
 
-
 
NC_004310  BR1685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.4 
 
 
533 aa  360  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3192  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.19 
 
 
531 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1629  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.4 
 
 
533 aa  360  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6798  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.19 
 
 
531 aa  358  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.46 
 
 
529 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0926  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.69 
 
 
528 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3021  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.61 
 
 
531 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2378  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.6 
 
 
541 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0367603  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.16 
 
 
531 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.38 
 
 
531 aa  357  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0660  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.66 
 
 
535 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1229  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.53 
 
 
533 aa  356  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270378  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.12 
 
 
528 aa  356  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.877269 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15401  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.62 
 
 
528 aa  356  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0931759  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1119  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.54 
 
 
529 aa  355  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3759  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.67 
 
 
526 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0672  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.46 
 
 
535 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0431754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.21 
 
 
527 aa  352  7e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.24 
 
 
523 aa  352  1e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1352  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.35 
 
 
534 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15151  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.24 
 
 
528 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.35 
 
 
531 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6394  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.19 
 
 
531 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1198  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.3 
 
 
542 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0190635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2256  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.24 
 
 
532 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.96 
 
 
531 aa  350  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3100  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.43 
 
 
525 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.659114 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15551  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.86 
 
 
528 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14091  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.37 
 
 
528 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.187324  normal  0.0498894 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.43 
 
 
523 aa  350  4e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1376  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.69 
 
 
528 aa  350  5e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.96 
 
 
531 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570425  hitchhiker  0.00544887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1961  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.81 
 
 
532 aa  349  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.829673  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1452  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.05 
 
 
528 aa  349  7e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.21 
 
 
539 aa  349  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000359421  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1737  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.68 
 
 
541 aa  349  8e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4778  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.67 
 
 
527 aa  349  8e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3620  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.38 
 
 
525 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.737909  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>