40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0584 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.49 
 
 
1953 aa  1076    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  54.61 
 
 
1842 aa  843    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.28 
 
 
3015 aa  920    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  54.61 
 
 
1865 aa  847    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
2302 aa  4475    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1537  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.3 
 
 
3152 aa  629  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1721  hypothetical protein  97.65 
 
 
86 aa  167  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.508273  hitchhiker  0.00134351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  32.7 
 
 
646 aa  70.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  32.7 
 
 
646 aa  70.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  31.3 
 
 
3391 aa  63.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.48 
 
 
1242 aa  61.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  26.01 
 
 
636 aa  60.1  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  32.73 
 
 
629 aa  58.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  32.12 
 
 
629 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  31.71 
 
 
629 aa  56.6  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  32.12 
 
 
626 aa  55.5  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  29.92 
 
 
1672 aa  55.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.35 
 
 
1489 aa  53.5  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  23.08 
 
 
1001 aa  53.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  26.29 
 
 
759 aa  52.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  24.9 
 
 
1056 aa  52.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  22.61 
 
 
1769 aa  51.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  26.34 
 
 
816 aa  50.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  26.39 
 
 
1508 aa  51.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1114  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.14 
 
 
1358 aa  50.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  25 
 
 
998 aa  50.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  25.62 
 
 
763 aa  50.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.78 
 
 
1357 aa  48.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.05 
 
 
3629 aa  48.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  22.27 
 
 
1001 aa  49.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0687  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.64 
 
 
1044 aa  49.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  24.25 
 
 
1179 aa  48.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  24.86 
 
 
831 aa  48.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  25.1 
 
 
985 aa  47.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  21.61 
 
 
1677 aa  47.8  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  23.68 
 
 
10429 aa  47.8  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.48 
 
 
1673 aa  47  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  22.93 
 
 
983 aa  46.6  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  29.41 
 
 
1093 aa  45.8  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  29.41 
 
 
1093 aa  45.8  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>