22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0687 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0687  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
1044 aa  2078    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1114  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.34 
 
 
1358 aa  509  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0892  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.96 
 
 
815 aa  90.1  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  22.54 
 
 
991 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  24.48 
 
 
1001 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  22.54 
 
 
995 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  25.95 
 
 
1001 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0263  polymorphic membrane protein G family protein  27.09 
 
 
987 aa  58.2  0.0000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.16 
 
 
1489 aa  57.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  23.4 
 
 
983 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1620  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.51 
 
 
1054 aa  57  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  22.39 
 
 
1369 aa  55.5  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  22.53 
 
 
831 aa  52.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  23.31 
 
 
1782 aa  51.6  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.64 
 
 
1865 aa  50.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.64 
 
 
1842 aa  49.3  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.64 
 
 
2302 aa  49.3  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  22.14 
 
 
1769 aa  48.9  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.1 
 
 
1242 aa  48.9  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  25.35 
 
 
1025 aa  45.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.76 
 
 
3015 aa  44.7  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.76 
 
 
1953 aa  44.7  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>