More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5748 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  100 
 
 		 452 aa  885    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  58.94 
 
 		 484 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  56.73 
 
 		 449 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  56.04 
 
 		 467 aa  411  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  57 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  56.83 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  48.48 
 
 		 518 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  49.57 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  59.05 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  49.54 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  52.2 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  52.27 
 
 		 482 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  52.28 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  53.08 
 
 		 448 aa  362  6e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  57.95 
 
 		 414 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  49.77 
 
 		 487 aa  356  5e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  49.54 
 
 		 429 aa  348  8e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  50.7 
 
 		 478 aa  348  9e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3118  Cysteine desulfurase  52.63 
 
 		 476 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  53.3 
 
 		 445 aa  347  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  33.49 
 
 		 442 aa  240  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  37.47 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  36.24 
 
 		 470 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  38.36 
 
 		 485 aa  229  8e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  30.94 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  30.94 
 
 		 428 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  36.45 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  37.24 
 
 		 879 aa  209  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.53 
 
 		 657 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  40 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.5 
 
 		 409 aa  203  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  37.22 
 
 		 395 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.82 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  34.82 
 
 		 420 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.42 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.89 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.43 
 
 		 662 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.82 
 
 		 413 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.28 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.55 
 
 		 413 aa  196  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  32.49 
 
 		 414 aa  196  7e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.81 
 
 		 429 aa  196  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.31 
 
 		 403 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  39.18 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.05 
 
 		 673 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.25 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.95 
 
 		 409 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  33.74 
 
 		 408 aa  193  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.39 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.02 
 
 		 406 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.62 
 
 		 412 aa  192  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.78 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  32.23 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.11 
 
 		 418 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  33.68 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.16 
 
 		 414 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.07 
 
 		 418 aa  190  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  37 
 
 		 414 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.29 
 
 		 413 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  33.68 
 
 		 414 aa  189  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.23 
 
 		 415 aa  189  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.57 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.23 
 
 		 412 aa  189  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.66 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.8 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.94 
 
 		 414 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.62 
 
 		 885 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  38.08 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.28 
 
 		 664 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.77 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.57 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  34.55 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.68 
 
 		 406 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  32.65 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.63 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.57 
 
 		 414 aa  187  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.12 
 
 		 410 aa  187  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.46 
 
 		 406 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.46 
 
 		 406 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  32.65 
 
 		 404 aa  186  7e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  34.36 
 
 		 604 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  34.36 
 
 		 604 aa  186  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.46 
 
 		 406 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.17 
 
 		 672 aa  186  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.68 
 
 		 406 aa  186  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.17 
 
 		 674 aa  186  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.41 
 
 		 412 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.46 
 
 		 406 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  38.42 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.68 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.4 
 
 		 406 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.58 
 
 		 415 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.47 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  37.22 
 
 		 414 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.47 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  33.86 
 
 		 666 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.67 
 
 		 417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.96 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.34 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>