More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5232 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 605 aa  1189    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5929  gamma-glutamyltransferase  56.77 
 
 		 628 aa  594  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1525  Gamma-glutamyltransferase  57.89 
 
 		 596 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0104264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2332  gamma-glutamyltransferase  59.77 
 
 		 602 aa  579  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  59.16 
 
 		 595 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2007  gamma-glutamyltransferase  53.67 
 
 		 613 aa  560  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408979  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  57.49 
 
 		 614 aa  549  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2611  gamma-glutamyltransferase  55.63 
 
 		 646 aa  549  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  54.23 
 
 		 620 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2446  gamma-glutamyltransferase  56.2 
 
 		 624 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605656  normal  0.196083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  55.11 
 
 		 612 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  50.62 
 
 		 579 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  44.12 
 
 		 595 aa  343  5.999999999999999e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  42.83 
 
 		 596 aa  342  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  40.08 
 
 		 588 aa  333  6e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  39.47 
 
 		 588 aa  331  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  42.16 
 
 		 595 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  42.06 
 
 		 593 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  38.18 
 
 		 606 aa  328  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  39.93 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  36.62 
 
 		 581 aa  325  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  39.96 
 
 		 589 aa  325  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  39.17 
 
 		 586 aa  321  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  40.27 
 
 		 594 aa  320  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  38.68 
 
 		 581 aa  313  6.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  37.27 
 
 		 645 aa  313  7.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  40.41 
 
 		 619 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  37.29 
 
 		 645 aa  310  5e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  36.48 
 
 		 590 aa  310  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  35.9 
 
 		 586 aa  310  6.999999999999999e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  41.78 
 
 		 601 aa  309  6.999999999999999e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  39.48 
 
 		 577 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  36.41 
 
 		 617 aa  308  3e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  37.18 
 
 		 583 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  34.27 
 
 		 581 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  38.85 
 
 		 577 aa  306  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  36.5 
 
 		 580 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  36.5 
 
 		 581 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  36.5 
 
 		 580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  36.5 
 
 		 580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  36.5 
 
 		 580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  36.5 
 
 		 580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  36.55 
 
 		 580 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  37.33 
 
 		 576 aa  303  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  41.44 
 
 		 575 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  36.55 
 
 		 577 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  36.05 
 
 		 581 aa  302  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  39.35 
 
 		 583 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  36.36 
 
 		 580 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  36.55 
 
 		 581 aa  301  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  36.36 
 
 		 580 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  34.72 
 
 		 576 aa  300  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  36.62 
 
 		 586 aa  300  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  37.9 
 
 		 587 aa  300  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  35.73 
 
 		 599 aa  300  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  36.18 
 
 		 580 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  36.18 
 
 		 580 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  36.78 
 
 		 583 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  39.29 
 
 		 594 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  37.52 
 
 		 586 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  37.76 
 
 		 586 aa  298  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  36.07 
 
 		 580 aa  296  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 		 582 aa  294  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  39.6 
 
 		 583 aa  293  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  34.84 
 
 		 579 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  37.56 
 
 		 610 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  36.33 
 
 		 576 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  36.01 
 
 		 556 aa  291  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  35.75 
 
 		 619 aa  290  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  37.72 
 
 		 653 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  39.55 
 
 		 589 aa  289  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  35.63 
 
 		 556 aa  288  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  38.38 
 
 		 669 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  36.32 
 
 		 625 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  35.16 
 
 		 579 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  38.39 
 
 		 584 aa  286  7e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  38.45 
 
 		 624 aa  284  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  36.56 
 
 		 588 aa  284  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  34.63 
 
 		 580 aa  283  7.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  36.81 
 
 		 624 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  36.36 
 
 		 579 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  36.81 
 
 		 624 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  34.93 
 
 		 578 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  35.44 
 
 		 576 aa  282  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  36.31 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  36.31 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  35.44 
 
 		 576 aa  282  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  37 
 
 		 648 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  36.13 
 
 		 579 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  36.07 
 
 		 599 aa  281  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  36.81 
 
 		 624 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  36.63 
 
 		 581 aa  280  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  35.9 
 
 		 625 aa  280  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  36.55 
 
 		 618 aa  279  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  35.34 
 
 		 596 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  35.34 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  35.93 
 
 		 596 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  35.25 
 
 		 626 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2090  gamma-glutamyltransferase  36.78 
 
 		 606 aa  278  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.184106  normal  0.0259865 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  35.26 
 
 		 579 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>