69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4269 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  100 
 
 
256 aa  521  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  61.01 
 
 
220 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  59.72 
 
 
219 aa  255  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  56 
 
 
222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  54.22 
 
 
222 aa  241  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  52.63 
 
 
301 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  53.77 
 
 
304 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  53.23 
 
 
273 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  53.23 
 
 
273 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  53.23 
 
 
273 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  49.55 
 
 
449 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  51.22 
 
 
236 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  47.06 
 
 
225 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  46.49 
 
 
232 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  44.04 
 
 
223 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  44.34 
 
 
243 aa  185  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  44.75 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  42.65 
 
 
231 aa  168  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  42.73 
 
 
225 aa  161  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  43.94 
 
 
229 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  45.41 
 
 
225 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  43.43 
 
 
230 aa  158  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  41.74 
 
 
327 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  37.99 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  41.3 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  36.8 
 
 
532 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  38.89 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  40 
 
 
221 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  36.36 
 
 
453 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  39.81 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  35.61 
 
 
202 aa  105  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  33.66 
 
 
227 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  33.18 
 
 
216 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  37.8 
 
 
209 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  34.41 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  28.96 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  29.44 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  28.14 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  29.67 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  28.88 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  26.47 
 
 
247 aa  56.2  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  30.95 
 
 
225 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45623  predicted protein  30.66 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  27.32 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  26.56 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  29.8 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  36.05 
 
 
238 aa  46.2  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  27.37 
 
 
222 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  28.35 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  23.59 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  30.81 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2644  hypothetical protein  25 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  26.46 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  31.52 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  27.65 
 
 
428 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  30.81 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  36.47 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  23.59 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  27.1 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  25.41 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  31.87 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  30.97 
 
 
225 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  31.37 
 
 
229 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 
426 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  30.7 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  29.2 
 
 
226 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  22.65 
 
 
232 aa  42.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  28.33 
 
 
232 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22620  hypothetical protein  30.16 
 
 
253 aa  42  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>