40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2703 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  100 
 
 		 586 aa  1104    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  41.68 
 
 		 1243 aa  196  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  39.68 
 
 		 3373 aa  183  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  35.96 
 
 		 5166 aa  177  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  36.19 
 
 		 5203 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  32.21 
 
 		 2047 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  27.15 
 
 		 1337 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  27.15 
 
 		 1337 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  34.41 
 
 		 666 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  27.56 
 
 		 2604 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  27.87 
 
 		 1263 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  28.28 
 
 		 2656 aa  95.9  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  25.15 
 
 		 5544 aa  84.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  29.67 
 
 		 5517 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  24.48 
 
 		 733 aa  82  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  27.94 
 
 		 965 aa  79.7  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  27.94 
 
 		 965 aa  79.7  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  30.42 
 
 		 733 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  29.1 
 
 		 8918 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  29.35 
 
 		 892 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  23.58 
 
 		 1531 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  26.37 
 
 		 1153 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  26.37 
 
 		 1153 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  25.98 
 
 		 2990 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  28.51 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  26.27 
 
 		 2876 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1727 aa  59.7  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1809 aa  58.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  26.99 
 
 		 2890 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  32.7 
 
 		 382 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  27.21 
 
 		 3324 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  26.48 
 
 		 2112 aa  54.3  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  27.78 
 
 		 382 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  29.52 
 
 		 870 aa  50.8  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6955  hypothetical protein  34.38 
 
 		 396 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  38.32 
 
 		 2000 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  37.86 
 
 		 1984 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1665 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0506  hypothetical protein  65.52 
 
 		 941 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0857444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1504 aa  44.3  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>