51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2393 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2393  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  296  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  32.33 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3478  hypothetical protein  36 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00929426  hitchhiker  0.00647977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3789  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379829  hitchhiker  0.00361313 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  29.41 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  37.86 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2394  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.629641  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  28.85 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  28.68 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  34.23 
 
 		 208 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4641  hypothetical protein  33.6 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  38.75 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 193 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 158 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 175 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 146 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 219 aa  41.2  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>