More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1415 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  100 
 
 
657 aa  1308    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  54.06 
 
 
658 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04390  molecular chaperone  43.42 
 
 
665 aa  326  9e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48656  normal  0.554672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6569  Heat shock protein 70  47.65 
 
 
643 aa  319  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2974  Heat shock protein 70  46.82 
 
 
473 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458744  normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6358  heat shock protein 70  44.91 
 
 
380 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0352  Heat shock protein 70  46.42 
 
 
858 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3675  Heat shock protein 70  45.89 
 
 
698 aa  267  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201192  normal  0.0422878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2693  Heat shock protein 70  44.41 
 
 
597 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122033  normal  0.114387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3550  Heat shock protein 70  43.93 
 
 
632 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.149708  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3114  WD-40 repeat protein  41.05 
 
 
816 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122668  normal  0.0357376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5965  Molecular chaperone-like protein  39.14 
 
 
861 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000466156  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0643  chaperone protein HscA  42.68 
 
 
355 aa  190  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1150  heat shock protein 70  36.5 
 
 
414 aa  171  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  38.06 
 
 
631 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  37.01 
 
 
880 aa  160  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3087  Heat shock protein 70  37.29 
 
 
683 aa  158  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1636  heat shock protein 70  36.73 
 
 
632 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1538  molecular chaperone protein DnaK  29.5 
 
 
639 aa  140  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.163821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2420  Heat shock protein 70  27.92 
 
 
649 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2419  Heat shock protein 70  29.2 
 
 
640 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2007  molecular chaperone DnaK  30.69 
 
 
644 aa  137  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  30.69 
 
 
644 aa  137  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  33.85 
 
 
872 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3574  chaperone protein DnaK  30.37 
 
 
639 aa  134  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.662017  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1250  molecular chaperone DnaK  29.17 
 
 
630 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3964  molecular chaperone DnaK  30.63 
 
 
637 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.734974 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2733  molecular chaperone DnaK  30.13 
 
 
643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000184427  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0889  molecular chaperone DnaK  29.21 
 
 
617 aa  132  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2498  molecular chaperone DnaK  29.82 
 
 
653 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.821705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2576  molecular chaperone DnaK  30.31 
 
 
646 aa  131  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000174764 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  28.69 
 
 
620 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  26.69 
 
 
619 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3362  molecular chaperone DnaK  31.61 
 
 
641 aa  130  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00483084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4416  molecular chaperone DnaK  30.26 
 
 
638 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3218  molecular chaperone DnaK  29.61 
 
 
646 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  29.18 
 
 
607 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4505  dnaK protein  28.8 
 
 
638 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.493452  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0737  molecular chaperone DnaK  29.9 
 
 
650 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364172  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0350  molecular chaperone DnaK  30.18 
 
 
631 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.759772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4387  2-alkenal reductase  28.57 
 
 
578 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0306  molecular chaperone DnaK  29.21 
 
 
638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0571  chaperone protein DnaK  29.13 
 
 
651 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  29.1 
 
 
612 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  28.9 
 
 
607 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  26.69 
 
 
619 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  29.18 
 
 
605 aa  129  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0145  heat shock protein 70  31.74 
 
 
577 aa  129  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3961  molecular chaperone DnaK  30.05 
 
 
653 aa  129  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727521  normal  0.0784984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4096  molecular chaperone DnaK  30 
 
 
639 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1194  molecular chaperone DnaK  29.95 
 
 
635 aa  128  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00921212  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2571  molecular chaperone DnaK  29.35 
 
 
646 aa  128  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1226  molecular chaperone DnaK  29.35 
 
 
654 aa  128  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0562315  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2846  molecular chaperone DnaK  30.62 
 
 
636 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.769317  normal  0.885007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0923  heat shock protein Hsp70  28.76 
 
 
645 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.831723  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1181  molecular chaperone, DnaK family  27.42 
 
 
636 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0502129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  29.1 
 
 
608 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42970  molecular chaperone DnaK  28.8 
 
 
642 aa  127  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  29.95 
 
 
638 aa  127  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  29.95 
 
 
638 aa  127  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0014  molecular chaperone DnaK  29.95 
 
 
638 aa  127  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.720404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0014  molecular chaperone DnaK  29.95 
 
 
638 aa  127  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00014  hypothetical protein  29.95 
 
 
638 aa  127  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0017  molecular chaperone DnaK  29.95 
 
 
638 aa  127  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0012  molecular chaperone DnaK  29.95 
 
 
638 aa  127  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  29.47 
 
 
632 aa  127  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  27.82 
 
 
643 aa  127  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3642  molecular chaperone DnaK  29.95 
 
 
638 aa  127  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297376  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0015  molecular chaperone DnaK  29.95 
 
 
638 aa  127  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  29.47 
 
 
637 aa  127  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  27.89 
 
 
644 aa  127  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2041  molecular chaperone DnaK  29.47 
 
 
637 aa  127  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0128  chaperone protein DnaK  29.13 
 
 
632 aa  127  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860677  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  29.1 
 
 
634 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3624  molecular chaperone DnaK  28.53 
 
 
637 aa  127  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2785  molecular chaperone DnaK  30.05 
 
 
647 aa  127  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2239  molecular chaperone DnaK  28.46 
 
 
644 aa  127  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0425957  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3094  chaperone DnaK  30.05 
 
 
644 aa  127  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0408879  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1900  molecular chaperone DnaK  30.47 
 
 
671 aa  127  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.393588  normal  0.969601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  31.12 
 
 
641 aa  126  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1142  dnak protein, truncation  28.57 
 
 
505 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02253  molecular chaperone DnaK  30.36 
 
 
642 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.402968  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  29.21 
 
 
630 aa  126  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1208  molecular chaperone DnaK  26.89 
 
 
636 aa  126  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1501  Heat shock protein 70  30 
 
 
529 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2674  molecular chaperone DnaK  28.31 
 
 
637 aa  126  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3853  molecular chaperone DnaK  30.08 
 
 
635 aa  126  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.458141  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3585  Heat shock protein 70  31.01 
 
 
525 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219704  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  27.15 
 
 
637 aa  125  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2635  molecular chaperone DnaK  29.61 
 
 
688 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0170334  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0310  molecular chaperone DnaK  29.21 
 
 
644 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2311  chaperone protein DnaK  28.53 
 
 
620 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000072076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  32.83 
 
 
935 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0581  molecular chaperone DnaK  30.08 
 
 
639 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1969  molecular chaperone DnaK  30.57 
 
 
651 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00608101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2922  molecular chaperone DnaK  29.9 
 
 
648 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797914  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1873  Heat shock protein 70  30.19 
 
 
527 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0915077  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1987  molecular chaperone DnaK  29.92 
 
 
639 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0969  molecular chaperone DnaK  29.7 
 
 
638 aa  126  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.291129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1526  molecular chaperone DnaK  28.65 
 
 
647 aa  126  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>