158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1375 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
374 aa  769    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  65 
 
 
392 aa  461  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2694  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  56.1 
 
 
399 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  53.39 
 
 
382 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.19 
 
 
402 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.93 
 
 
406 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  53.12 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.12 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.12 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  51.05 
 
 
429 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.48 
 
 
370 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.86 
 
 
364 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.22 
 
 
361 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.37 
 
 
361 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  44.33 
 
 
370 aa  259  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.69 
 
 
441 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  41.18 
 
 
440 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.39 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.77 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.17 
 
 
349 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.54 
 
 
330 aa  179  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  35.44 
 
 
346 aa  176  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  33.43 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.23 
 
 
368 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.04 
 
 
349 aa  170  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  36.31 
 
 
354 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.34 
 
 
359 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.58 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  40.45 
 
 
315 aa  166  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  35.54 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.69 
 
 
355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.21 
 
 
399 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  35.58 
 
 
369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.14 
 
 
360 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.08 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.2 
 
 
372 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  32.53 
 
 
365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.26 
 
 
233 aa  92.8  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.87 
 
 
215 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.51 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  40.78 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  32.64 
 
 
203 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  34.86 
 
 
192 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25.36 
 
 
210 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  50.77 
 
 
141 aa  59.7  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0244  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.6 
 
 
214 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.9 
 
 
199 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25.65 
 
 
206 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.19 
 
 
151 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  28.3 
 
 
220 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  39.71 
 
 
160 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  31.82 
 
 
168 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.31 
 
 
435 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  41.67 
 
 
163 aa  53.9  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.65 
 
 
130 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
175 aa  52.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.08 
 
 
141 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  45.45 
 
 
205 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.17 
 
 
642 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.43 
 
 
146 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  37.65 
 
 
149 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.67 
 
 
122 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.79 
 
 
159 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3894  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.04 
 
 
175 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.32 
 
 
199 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  43.64 
 
 
168 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  33.33 
 
 
170 aa  50.4  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 
173 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.14 
 
 
640 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.42 
 
 
239 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.33 
 
 
166 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.03 
 
 
179 aa  49.7  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  36.17 
 
 
173 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
136 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.73 
 
 
155 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  40.3 
 
 
148 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  44.83 
 
 
159 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.71 
 
 
130 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.57 
 
 
171 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0192  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.13 
 
 
193 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014793  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  36.67 
 
 
165 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1208  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  40.98 
 
 
177 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.24 
 
 
161 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.91 
 
 
130 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.33 
 
 
134 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1794  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
178 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  34.72 
 
 
178 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0628  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  34.72 
 
 
178 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.448712  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05171  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
178 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.900646  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1686  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.28 
 
 
124 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.64 
 
 
175 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0118  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.53 
 
 
166 aa  47  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1419  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  39.44 
 
 
179 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000338056  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1913  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.1 
 
 
184 aa  47  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.46 
 
 
130 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0462  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.05 
 
 
178 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2712  Rieske (2Fe-2S) region  36.11 
 
 
206 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 
381 aa  46.6  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04871  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.05 
 
 
178 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>