245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1208 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1208  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
267 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  46.85 
 
 
264 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  52.99 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  46.84 
 
 
260 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  44.13 
 
 
252 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  46.06 
 
 
253 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  45.64 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  43.32 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  45.64 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  45.93 
 
 
256 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  49.15 
 
 
264 aa  182  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  49.14 
 
 
262 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  47.58 
 
 
253 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  47.83 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  51.41 
 
 
258 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  43.98 
 
 
263 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  46.72 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  46.45 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  46 
 
 
253 aa  171  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  41.06 
 
 
252 aa  168  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  41.06 
 
 
252 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  42.29 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  44.44 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  41.56 
 
 
252 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1793  hypothetical protein  47.47 
 
 
254 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.607565  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  42.28 
 
 
252 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  42.91 
 
 
252 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  39.09 
 
 
255 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  39.2 
 
 
259 aa  155  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  46.26 
 
 
255 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  47.13 
 
 
267 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  41.8 
 
 
252 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  39.27 
 
 
252 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  44.81 
 
 
252 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06970  predicted permease  51.33 
 
 
290 aa  151  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  42.8 
 
 
252 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  42.21 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0553  protein of unknown function DUF81  50.47 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0959  hypothetical protein  47.87 
 
 
259 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  36.8 
 
 
255 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  36.67 
 
 
255 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  36.67 
 
 
255 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  39.66 
 
 
261 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  37.76 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  36.67 
 
 
255 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2578  hypothetical protein  45.66 
 
 
264 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  36.25 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  36.25 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  36.08 
 
 
266 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0832  hypothetical protein  37.55 
 
 
254 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2209  protein of unknown function DUF81  47.62 
 
 
255 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  34.54 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  36.8 
 
 
255 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  36.25 
 
 
255 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  36.78 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1064  protein of unknown function DUF81  36.21 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  47.23 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  35.83 
 
 
255 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  35.83 
 
 
255 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  37.61 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  36.82 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  38.06 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  36.47 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  36.47 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  36.47 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  36.21 
 
 
261 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  34.54 
 
 
261 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  36.13 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  37.29 
 
 
255 aa  131  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  36.44 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  34.4 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  36.13 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  35.02 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  36.32 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  35.29 
 
 
254 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  36.96 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  35.94 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  36.43 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  34.3 
 
 
269 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  34.3 
 
 
269 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  34.3 
 
 
269 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  34.3 
 
 
269 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  33.88 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  36.25 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  36.25 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  35.94 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  34.63 
 
 
256 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0842  hypothetical protein  39.57 
 
 
262 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.213592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  36.93 
 
 
257 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  34.91 
 
 
256 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  34.91 
 
 
256 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  32.11 
 
 
256 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  34.57 
 
 
253 aa  124  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  32.5 
 
 
257 aa  124  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  34.2 
 
 
256 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  34.91 
 
 
256 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  34.98 
 
 
265 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  33.6 
 
 
256 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  34.91 
 
 
256 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  34.91 
 
 
256 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>