More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0604 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0604  ribosomal protein S18  100 
 
 		 77 aa  153  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  69.44 
 
 		 79 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  69.44 
 
 		 93 aa  106  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  67.57 
 
 		 79 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  65.28 
 
 		 78 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  62.82 
 
 		 78 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  63.89 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5492  30S ribosomal protein S18  70.15 
 
 		 83 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.115937  normal  0.0428851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  61.11 
 
 		 78 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  63.16 
 
 		 81 aa  97.1  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  59.72 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  60.26 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  67.69 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1465  ribosomal protein S18  69.44 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159175  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  67.69 
 
 		 78 aa  94.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1309  ribosomal protein S18  75.86 
 
 		 63 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 78 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3698  ribosomal protein S18  67.69 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  66.15 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  58.97 
 
 		 79 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  58.97 
 
 		 79 aa  94  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  63.89 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0310  ribosomal protein S18  74.55 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0899357 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23240  30S ribosomal protein S18  60.26 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  63.64 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 		 78 aa  92.8  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1217  30S ribosomal protein S18  68.97 
 
 		 82 aa  90.9  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.86687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  59.42 
 
 		 81 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 85 aa  88.2  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7041  30S ribosomal protein S18  60.94 
 
 		 79 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  60.61 
 
 		 78 aa  86.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  62.3 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  52.78 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2341  ribosomal protein S18  69.09 
 
 		 85 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.159544 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  55.38 
 
 		 87 aa  83.6  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39410  SSU ribosomal protein S18P  63.16 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12092  30S ribosomal protein S18  75.38 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000379639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  48.61 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  65.45 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5368  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  62.71 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6032  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  48.61 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  50.79 
 
 		 80 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  49.21 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  49.21 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3294  ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  49.18 
 
 		 75 aa  70.1  0.000000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  47.69 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  50.7 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  47.69 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  52.73 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  51.72 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  44.59 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  62 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  45.31 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  62 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  45.31 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  48.39 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  59.62 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  49.21 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  46.15 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  45.45 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  45.45 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  44.44 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  52.73 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  46.88 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  47.22 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  46.67 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  43.08 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>