More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2697 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2697  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  595  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1700  protein of unknown function DUF344  77.99 
 
 
286 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484531  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  77.99 
 
 
286 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1514  hypothetical protein  74.82 
 
 
281 aa  427  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.744458 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4488  hypothetical protein  69.34 
 
 
286 aa  410  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.521418  normal  0.0804877 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4523  hypothetical protein  75.1 
 
 
284 aa  410  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.872957  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6004  hypothetical protein  62.02 
 
 
280 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47701  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  65.02 
 
 
265 aa  367  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6193  hypothetical protein  64.5 
 
 
265 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1410  hypothetical protein  63.28 
 
 
268 aa  348  6e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0994323  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1864  hypothetical protein  62.3 
 
 
263 aa  337  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844813  normal  0.705337 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1892  hypothetical protein  58.5 
 
 
261 aa  325  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1566  protein of unknown function DUF344  58.5 
 
 
261 aa  325  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0130  hypothetical protein  60.96 
 
 
263 aa  324  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.898159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1582  hypothetical protein  60.43 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  53.04 
 
 
314 aa  281  6.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  55.6 
 
 
269 aa  281  9e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  49.62 
 
 
293 aa  278  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  51.38 
 
 
269 aa  277  2e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4849  hypothetical protein  64 
 
 
272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0355335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  55.17 
 
 
405 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  55.91 
 
 
276 aa  271  8.000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1667  hypothetical protein  60.27 
 
 
251 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.157916  normal  0.465786 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  54.05 
 
 
293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  55.61 
 
 
375 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  53.81 
 
 
326 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  53.36 
 
 
303 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  53.02 
 
 
393 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  51.68 
 
 
364 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0369  hypothetical protein  52.38 
 
 
253 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  52.89 
 
 
369 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  49.8 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  48.95 
 
 
263 aa  262  4.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  52.54 
 
 
326 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  51.43 
 
 
338 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  52.54 
 
 
357 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  53.25 
 
 
365 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  48.08 
 
 
301 aa  260  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  50.58 
 
 
340 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  48.95 
 
 
314 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  52.44 
 
 
383 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  52.47 
 
 
262 aa  259  3e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  51.22 
 
 
316 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  55.16 
 
 
367 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  51.69 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  50.19 
 
 
336 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  50.84 
 
 
324 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  49.58 
 
 
329 aa  256  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  48.99 
 
 
293 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  52.12 
 
 
298 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  50.61 
 
 
304 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  53.15 
 
 
391 aa  255  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  51.07 
 
 
284 aa  255  6e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  48.15 
 
 
311 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  50.41 
 
 
289 aa  255  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  48.4 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  53.16 
 
 
304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  52.28 
 
 
316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  48.18 
 
 
300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  54.75 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  52.79 
 
 
320 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  48.95 
 
 
297 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  53.22 
 
 
305 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  53.11 
 
 
304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  48.58 
 
 
293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  51.87 
 
 
310 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  52.77 
 
 
304 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  49.39 
 
 
296 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  52.77 
 
 
304 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  54.5 
 
 
310 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  51.69 
 
 
280 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  49.39 
 
 
302 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  50.84 
 
 
327 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  47.58 
 
 
299 aa  249  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  52.32 
 
 
304 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  50 
 
 
276 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  51.48 
 
 
316 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  52.12 
 
 
294 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  52.12 
 
 
294 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  52.12 
 
 
294 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  52.32 
 
 
316 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  51.43 
 
 
338 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  51.24 
 
 
300 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  52.32 
 
 
316 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  52.32 
 
 
316 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  52.28 
 
 
304 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  52.99 
 
 
316 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  51.5 
 
 
308 aa  248  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  53.3 
 
 
513 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  51.45 
 
 
308 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  51.45 
 
 
308 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  51.45 
 
 
308 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  52.86 
 
 
314 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  46.64 
 
 
296 aa  247  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  45.11 
 
 
296 aa  247  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  52.5 
 
 
322 aa  247  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  50 
 
 
256 aa  246  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  51.77 
 
 
258 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  51.04 
 
 
308 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  51.05 
 
 
316 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>