265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1636 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1636  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
138 aa  279  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2078  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
138 aa  279  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.571486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5863  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 
132 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 
141 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  44.19 
 
 
143 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  51.28 
 
 
133 aa  87.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  42.72 
 
 
263 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  41.23 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  41.23 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 
265 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  41.44 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
260 aa  71.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  35.78 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  32.5 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1351  LysR, substrate-binding  52.86 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.7 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  35.14 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
178 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  35.78 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  33.62 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
175 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
137 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  32.76 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  33.62 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  32.03 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
139 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  26.19 
 
 
146 aa  60.1  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  31.86 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  32.79 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  30.83 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  31.86 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
169 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
185 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  33.05 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  33.05 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  26.4 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  26.4 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
139 aa  57  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
168 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  25.6 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3521  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.761017  normal  0.0424383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  30.53 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.31 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  26.23 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  31.93 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  31.15 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  30.4 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  26.5 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  30.4 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>