205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3488 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3488  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  219  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3640  transcriptional regulator, TraR/DksA family  93.91 
 
 
115 aa  204  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3572  transcriptional regulator, TraR/DksA family  93.04 
 
 
115 aa  202  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131957  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3132  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.75 
 
 
113 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2439  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.44 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.734932  normal  0.693819 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.11 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5995  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.84 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  34.95 
 
 
283 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  36 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.37 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.07 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  38 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  47.27 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.27 
 
 
134 aa  52  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.04 
 
 
212 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  47.27 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.27 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.39 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.67 
 
 
139 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.56 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  41.41 
 
 
158 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.41 
 
 
162 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.41 
 
 
158 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.19 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.41 
 
 
158 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.64 
 
 
243 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.19 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  31.53 
 
 
243 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  34.95 
 
 
236 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.74 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  31.53 
 
 
243 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  35 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.31 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.27 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.88 
 
 
120 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.88 
 
 
120 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.88 
 
 
120 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  29.73 
 
 
243 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  29.73 
 
 
243 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  35 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  29.73 
 
 
243 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.15 
 
 
297 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  29.73 
 
 
243 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  31.78 
 
 
243 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.84 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.27 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  31.78 
 
 
243 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  30.63 
 
 
243 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.76 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.21 
 
 
212 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.95 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  47.27 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.05 
 
 
275 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0036  dnaK suppressor protein  30.43 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.27 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.46 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3704  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.64 
 
 
223 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.25 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.65 
 
 
257 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.65 
 
 
257 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  36.27 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  47.27 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3381  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.64 
 
 
223 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.48 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.63 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  33.66 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.06 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0064  DnaK suppressor protein  30.43 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  34 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  36 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  28.3 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6440  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.45 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.19 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6194  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.14 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643826  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1457  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  34 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2476  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2999  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.141456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3137  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3090  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0808  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3107  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.89 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.45 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0344  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.65 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.84 
 
 
243 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0046  putative DNAK suppressor protein  31.63 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4379  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.65 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2993  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.33 
 
 
223 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  43.64 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.78 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.1 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3683  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 
281 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.79 
 
 
158 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2595  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.61 
 
 
134 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2533  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0895997  normal  0.563175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>